如何确定mirna在其mirna靶基因验证的结合区域

问题人评价,难度:0%miRNA是一类在人体内广泛分布的内源性非编码RNA,长度为19 -25个核苷酸,不同 miRNA在个体发育的不同阶段产生。miRNA通过与靶mRNA结合或引起靶mRNA的降解,进而特异性的影响相应基因的表达。请根据材料判断下列相关说法正确的是A.miRNA指导合成的肽链最多含有8个氨基酸B.miRNA在转录水平特异性的影响基因的表达过程C.不同miRNA在个体发育的不同阶段产生,与细胞分化有关D.不同miRNA的区别在于脱氧核苷酸的排列顺序不同马上分享给朋友:答案C点击查看答案解释本题暂无同学作出解析,期待您来作答点击查看解释相关试题怎么查找MIRNA与靶基因3‘UTR结合位点(基因,结合位点)
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怎么查找MIRNA与靶基因3‘UTR结合位点?能具体说下嘛
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SSAM-09 microRNA SNP分析
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SSAM-09:microRNA SNP分析
本模块分析目的是针对模式动物的miRNA不同区域的SNP位点和MAF进行统计分析。针对疾病模型下的miRNA突变分析,分析研究可能的SNP在miRNA本身及其靶基因结合区域上的分布和影响。我们将对miRNA的pri-mRNA,pre-miRNA以及miRNA靶基因序列进行分析,识别潜在的SNP功能位点。据文献研究提供证据表明Humanpre-miRNA的二级结构中存在不同位置上的SNP,我们将通过热力学稳定性分析方法评估SNP对pre-miRNA结构的影响;另外,我们也将对miRNA-Target靶基因相互作用位点做分析,评估对SNP对靶基因靶向性的影响。
(1)SNV,SNP与pri-miRNA关联分析;(2)&SNV,SNP与pre-miRNA关联分析SNV,SNP与miRNA靶基因关联分析;(3)&GWAS与miRNA关联分析:计算miRNA靶基因结合区域和侧翼序列上SNP的分布密度;(4)&GWAS与miRNA关联分析-根据GWAS的易感位点的分布和关联分析研究miRNA基因,pre-miRNA,及其miRNA靶基因是否存在易感loci。
图例:pri-miRNA与miRNA&seed区发生的基因多态性改变实例&
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MicroRNA(miRNA)是具有调控基因表达功能的非编码RNA,通常长度为~22nt,在基因表达的转录后调控水平发挥重要功能。成熟的miRNA是从较长的具有局部颈环解结构(stemloop-hairpin)的RNA序列加工而成。miRNA的生物产生机制途径最先发生与细胞核中的RNaseIII酶Drosha对pri-miRNA的颈环处碱基进行剪切,并生成~70-90bp的pre-miRNA发卡结构。pre-miRNA被转运至细胞质中,进一步由Dicer(RNaseIIIendonuclease)加工。Dicer识别双链RNA靠近颈环处的碱基并分离双链,产生两条单链,而其中一条链成为miRNA而互不的那条链则被降解。成熟miRNA序列一旦被释放生成,它将与mRNA的3&UTR的局部序列互补配对,并通过降解mRNA和抑制mRNA翻译而达到调控基因表达的目的。
miRNA是一类重要的基因表达调控因子,通常主要参与靶基因翻译的抑制过程,同时最近研究也表明miRNA在哺乳动物细胞系统中的主要功能是降低靶基因mRNA的水平。每种保守的哺乳动物的miRNA都调控着数百个不同的靶基因,显示出调控系统的复杂性和系统性。因此,miRNA现在被认为是与转录因子同样重要的调控细胞蛋白质成分的重要分子。同样的,miRNA基因也受到精确的转录调节,并与后续的靶基因作用形成跟完整和系统的分子作用网络。
图例.&miRNA,siRNA,&piRNA&调控网络示意图
miRNA-Seq测序技术服务
利用miRNA表达谱芯片或miRNA测序技术,BioGenius可以探索miRNA水平的调控机制。利用生物信息学分析方法,BioGenius可以鉴定样本差异表达的miRNA分子,miRNA的结构,探索miRNA靶基因对应结合调控机制规律。对于miRNA在疾病诊断中的分子标记物的鉴定与识别,BioGenius将采用强大准确的机器学习算法构建疾病(预后、诊断)模型。对于miRNA基因层面的讨论分析,BioGenius将对miRNA前体基因进行分析,包括前体基因的调控序列,启动子,甲基化调控,以及保守性特性。另外,我们也可以对miRNA之间形成的复杂的协同调控网络进行重构分析,即miRNA-miRNA网络;联通miRNA-靶基因调控网络,以及结合mRNA水平的顺式调控网络(cis-RNAregulatorynetwork),我们将还原重现复杂分子网络调控在疾病或正常细胞,组织中的作用。
另外,高通量NGS测序技术也可获取其他类型small&RNA;&Biogenius&还可以分析有关piRNA,&siRNA等研究方向的内容。
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