生存分析(生物统计)习题

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【求助】生存分析中COX回归变量选择问题
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这个帖子发布于2年零304天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
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本人在做A肿瘤回顾生存分析,有几个问题想请教:1.变量设置中将T(1-4)、N(0-3)、M、TNM总分期(1-4)设为4个变量是否合理?因为T分期、N分期与TNM总分期直接相关,在cox回归中是否互为干扰?2.方法选择中,enter,forward(条件,LR,wald),backward(条件,LR,wald)怎么选?想得出univariate data是一个变量分别做一次cox,还是直接用enter做一次就ok?看了一些网上的解答还是很疑惑3.为什么有的单因素我用KM法 log-rank检验无意义,但是放进cox反而有意义了????cox是只应该把单因素有意义的放进去吗???(我是全放进去做的,个人以为这样更能消除混杂因素,但被拒的一次评审意见里面提到这个问题,我也很疑惑)请战友们指教!!希望得到
大神解惑!
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你是在做危险因素分析吗?即评估X对Y的独立作用大小。还是建立预测模型?即用X1、X2、X3……对Y建立预测模型的方程?医学论文最常见的是第一种,分析X对Y的独立作用时要调整哪些可能的混杂因素?错误的做法:1、单因素分析,找出P值较小的因素2、把这些因素放到模型里,再用逐步回归方法剔除不需要的因素,建立最终回归模型。看这个例子:这里结局变量是Y2,先对Y2与X1、X2、X3、X4、X5的关系逐个做单因素分析。除X1外,其它4个X与Y2均有显著性关系。再作多元回归模型,把5个X同时放入模型中,结果X1还是不显著,X2、X3、X5仍然显著,X4变得不显著了。这里请注意每个回归系数的变化:X2没变化;X3变化较大,从0.41变成0.28;X4变化也较大,从3.32变成2.30;X5有一点变化,但不很大。问题是:X3的回归系数为什么会变化很大呢?接着看,X1不显著,把X1从模型中剔出,看方程二:X2 的回归系数还是没变化;X3也没变;X4、X5变化很小。鉴于X4不显著,再把X4从模型中剔出,得方程三:X2回归系数还是没变,X3的回归系数从0.28升到0.36,变化很大,X5有一点变化。不论调整什么,X2的回归系数都没变化,这是为什么呢?是因为X2与X1、X3、X4、X5都没有关系。X5的回归系数有变化,但不大,是为什么?是因为X5与其它X有相关,但关系不强。调整X4与不调整X4,X3 的回归系数变化很大,这是为什么呢?是因为X3与X4关系较大,不调整X4,X4 的作用就加到X3身上去了;调整了X4,就是把X4的作用从X3中剥离出来,这时看到X3的回归系数就变小了。如果分析的目的,是确定X3对Y2的作用,就应该选方程二,因为方程二中的回归系数,更确切地表达了X3对Y2的作用。而不能因为X4的p值不显著,就不调整X4,因为p值受样本量的影响。因此,在分析X对Y的作用时,是否要调整“C”呢?回答要不要调整“C”,先看“C”与Y有没有联系,用单因素分析,看“C”的P值。再看调整“C”与不调整“C”,X对Y的作用是否有变化。我们先运行基本模型,记录β1,再在该模型中加入“C”,看β1变化多大?再运行一个完整的模型,即调整所有可能的因素,然后从模型中剔除“C”,看X的回归系数β1 的变化。软件操作:可以用EmpowerStats软件,中文名“易侕统计”的模块自动实现:“数据分析”—“协变量的检查与筛选”
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丁香园版主
这个做法在logistic回归上是一个套路,但是其实没有必要,因为其它因素对这个因素的影响可能是正面的也可能是负面的,所以原则上这个做法是错误的,但是天.朝这种文章审稿环境你懂得,很多审稿专家就是半吊子,尤其在统计方法上,你说,他说你错了,你是跟他争辩呢还是打个哈哈?好消息是cox回归上没有强调一定要这样做。有没有可能出现单因素没有统计学意义,而多因素反而有意义的情况?-----必须有,这一段我比较忙,如果能到9月12号之后我可能有时间看看你的数据给你提提建议。
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四叶虫 编辑于
kingfisher_ree 请问星霖兄,您提到了两种情况,一种是判断危险因素,一种是做预测模型。那么在做预测模型时,应该如何进行变量选取和纳入呢?我看文献多是单因素分析中有统计意义的纳入多元分析。您的意见呢?从流行病学分析思路角度:危险因素分析是对一个或一类因变量(X)对结果变量(Y)的作用,需要考虑到其他影响X和Y关系的混杂因素(Z)和交互作用因子。运用的统计学分析方法是多元回归模型校正协变量,建模方法不同于预测模型。
预测模型常规用逐步回归根据P值构建方程或者用决策树等方法;
危险因素分析根据X回归系数变化选择协变量。危险因素研究的分析思路是回答下面3个问题:1)
X与Y是什么样的关系?还有哪些因素影响Y?2)
哪些因素影响X对Y的作用?增强还是减弱X对Y的作用?3)
考虑到其他因素的作用后,X对Y的独立作用是多少?预测模型是对影响Y的所有X进行分析,分析思路和危险因素分析完全不同包括3方面:
1.筛选预测因素
(1) 关于一个疾病Y的研究,通常是做危险因素研究。
分析X1对Y的独立作用成文发表;
再分析X2对Y的独立作用成文发表;
当研究领域的审稿人对X1、X2……Xn对Y的独立作用比较公认时,再用X1、X2……Xn对Y建立预测模型(2)因此,筛选预测因素需要根据临床意义和统计分析结果,并非“是单因素分析中有统计意义的纳入多元分析”。例如这篇影响因子10.58分的文章,很多变量的纳入,都是不参考单因素的p值。Arch Intern Med, ): p. 1068-74.2.构建多个模型进行比较3.内部或外部数据验证
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【求助】关于生存分析OS的问题
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这个帖子发布于3年零146天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
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请教各位大侠一个困惑我的问题,在做OS分析时发现最后图表中的线一条竖线到底,不知道是什么意思?既往做过的分析OS的线都是最后是一条直线,不知道为什么这次最后是条竖线,难道说明到了70几个月时患者都死亡了吗?可是还是有患者在70几个月时是生存的,请帮忙解释一下,万分感谢!!
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不知道为什么图黏贴不上
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【求助】生存分析
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生存分析遇到2个问题,请大家帮忙,非常感谢! 1、我想将一个连续性变量变为二分类变量进行生存分析,不想用中位值,该如何寻找最佳界值呢?可以用ROC曲线吗?(看过不下3篇文献都用了ROC曲线,但不知道他们怎么选择状态变量)如果可以用ROC曲线,状态变量是否可选择生存状态,将死亡作为阳性,生存作为阴性?若不可以用ROC曲线,用什么方法呢?2、小样本量可以不做COX回归多因素分析,只做kaplan-meier分析吗? 理由是?
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生存分析,可以用连续变量。如果用roc曲线分类,另外一个评价的指标是什么?要有相应的评价指标。cox和kaplan-meier分析分析的内容不一样。当然,小样本样本量不足,这大概可以算不做cox的理由吧。。。
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长生子释 生存分析遇到2个问题,请大家帮忙,非常感谢! 1、我想将一个连续性变量变为二分类变量进行生存分析,不想用中位值,该如何寻找最佳界值呢?可以用ROC曲线吗?(看过不下3篇文献都用了ROC曲线,但不知道他们怎么选择状态变量)如果可以用ROC曲线,状态变量是否可选择生存状态,将死亡作为阳性,生存作为阴性?若不可以用ROC曲线,用什么方法呢?2、小样本量可以不做COX回归多因素分析,只做kaplan-meier分析吗? 理由是? 你真的可以大胆地试一下:就选择状态变量,将死亡作为阳性,生存作为阴性。列出每个组段值对应的阳性例和阴性例数,做一下类ROC分析
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论文从来不反对创新,只要不荒唐就行。试试吧
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请教关于SPSS的生存分析效应值OR,RR,HR问题
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本人在用SPSS行生存分析COX回归,根据网上的教程的提示,基本完成。但是目前还有个问题很困惑,请班内高手指教。教程上说的 exp(B)指OR值;95%Ci for EXP(B)值OR值的95%可信区间。可是,我参考国外很多文章,却不是这样表示的,他们有的用HR表示,有的用RR表示。想请问如何在SPSS中计算出HR呢?
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顶一个怎么没人回答啊急!!!
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都一周了还是没人回答啊郁闷!
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给你个链接
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关于生存分析cox回归的问题
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各位大神,本人统计小白,刚接触生存分析。现在手里有108例病人,做cox回归,目前只有T分期,手术方式,年龄三个因素关系比较大。问题1:cox回归要求病例数是自变量的15-20倍?我是不是得加几个风险因素?问题2:T分期和手术方式好像不互相独立,我选一个分析时(要么是年龄+手术方式,要么年龄+T分期)两个因素都有统计学意义,三个一起分析时,总会排除一个,要么T分期,要么手术方式,我该怎么讨论?这两个因素是不是都是风险因素?
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MARK,吃瓜群众搬个马扎先占
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问题1:cox回归要求病例数是自变量的15-20倍?不需要,看你研究目的的。问题2:T分期和手术方式好像不互相独立,你是从什么结果知道的,共线性诊断?
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qazonly123 问题1:cox回归要求病例数是自变量的15-20倍?不需要,看你研究目的的。问题2:T分期和手术方式好像不互相独立,你是从什么结果知道的,共线性诊断?问题1 明白了,谢谢!问题2 我先是怀疑这两者有一定关系,所以我做了一个卡方检验,发现T分期与手术方式相关。另外还有问题,cox因子筛选方法有前进法,后退法等一系列方法,我该怎么选择,有什么办法能评价不同筛选方法得出结果的优劣吗?
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