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Kruppel样因子4KLF4在小鼠表皮干细胞中的表达和功能研究
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干细胞标记物Lgr5及其与肿瘤的相关性　
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干细胞标记物Lgr5及其与肿瘤的相关性　
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成体干细胞和胚胎干细胞标记物
Senthil Pazhanisamy (scendhil at gmail dot com)
Baylor College of Medicine, United States
朱婷婷 (zhutingting1012 at 126 dot com)
复旦大学生物医学研究所
http://dx.doi.org/10..3.200
更新 : ; 原始版 :
实验材料和方法
关于鉴定成体干细胞和胚胎干细胞的细胞标记物的全面综述。
A comprehensive review of cell markers for identifying adult stem cells and embryonic stem cells.
干细胞标记物是基因和蛋白产物，他们被科学家用来分离和鉴定干细胞。此外，干细胞也可以功能分析进行鉴定，功能分析被认为是鉴定和治疗的黄金标准。虽然，功能分析是确定干细胞的理想方法，但是它们的分子标记物只能提供系统化的方式来体现健康，稳健的干细胞群的特征。由于干细胞鉴定的及其复杂性，特异性，有效性和和缺乏特异性分子标记，关于其在治疗应用上的知识是非常有限的。此外，干细胞群的标记物特征经常随着起源，物种，所谓的多能性（全能型和多能性）而波动。尽管关于标记功能的知识有限，其独特的表达方式和时序为我们提供了有用的工具用来识别和分离干细胞。本综述探讨了在基于细胞的再生医学的关键应用中的，用于鉴定/分离和表征成体和胚胎干细胞的一些标记物系统。胚胎干细胞和其鉴定
胚胎干细胞（ES细胞）是从一种早期阶段胚胎-囊胚的内细胞团分离出的多能干细胞 [] ES细胞具有高潜能去分化成多种细胞类型 [] 。 换言之，多能性，哺乳动物发育的基础，被赋有巨大潜力去启动和发育几乎所有谱系的成熟生物体（除了那些形成胎盘或胚胎的） [] 。 未分化的胚胎干细胞（ES）和诱导多能干细胞（iPS）可以通过功能定义，功能是分化成来自外胚层，中胚层和内胚层的细胞并且在较晚的时间能形成所有类型细胞的能力。胚胎干细胞具有两种不同的性质，这使得它们对细胞治疗富有吸引力。首先，如胚胎干细胞来自于早期囊胚（一个非常早期的发育阶段），它保持非凡可塑性，能分化成构成人体大约200细胞类型的任何类型细胞 [] 。 基于信号的适当组合，胚胎干细胞将发育为成熟细胞，可以作为神经细胞，肌肉，骨骼，血液或其他需要的细胞类型。胚胎干细胞的另一个重要特点是其能保持未分化状态和无限分裂的能力。这些所谓的自我更新的细胞形成了无限明确定义，在基因和基因组上特征相同的干细胞。 [] 。 尽管我们对他们的巨大潜力有越来越多的认知，我们被限制在基于治疗途径的ES细胞的开发上。一个具有挑战性的任务是，鉴定ESC标记物也标记肿瘤干细胞 [] 。
因此，研究人员面临着从特别是TSCs（肿瘤胚胎细胞）中分离ESCs（胚胎干细胞）的艰巨挑战。另一个潜在的问题是，忽略它们的胚发生起源，人类和小鼠在多能性的机制上也是不同的。 细胞表面多能性标记物
两个同源域转录因子，Oct4和Nanog，是第一个被鉴定出来的，在ES细胞早期胚胎发育和多能性维持所必需的蛋白 [] 。 新兴的研究表明，除了Oct4，Sox2和Nanog，多能性所需的许多其它因子已被确定，包括Sall4，DAX1，Essrb，TBX3，TCL1，Rif1，Nac1和Zfp281 [] 。 这些多能性因子在胚胎干细胞中形成一个复杂的转录调控网络来同时调控 [] 。TRA-1-60 and TRA-1-81
TRA-1-60和TRA-1-81是人胚胎性癌（EC）细胞和人多能干细胞表面的抗原，这被广泛地用作鉴定和分离ESCs标志物 [,
] 。 此外，它们也经常用于评估诱导多能干细胞（iPS）的多能性状态。它们也在畸胎瘤和EG细胞中表达 [,
] 。 在分化时，视黄酸处理人胚胎干细胞，TRA-1-60和SSEA4表达水平随着时间降低， SSEA1表达水平随时间增加 [] 。 此外，他们还表达CD349/ frizzled-9，阶段特异性抗原 （SSEA）-4，OCT-4，Nanog和nestin。Oct-4和Nanog，以及一些细胞表面标记物（SSEA-1，SSEA-4，TRA-1-60，TRA1-81）已被用于表征小鼠和人胚胎干细胞（ESC） [] 。人小鼠ESCEGCECCESCEGCSSEA-1+-++SSEA-4+++TRA-1-60+++TRA-1-81+++AP+++++Fzd 1-10++TDGF-1+++表 1。 人类和小鼠来源的ESC，EGC和ECC分子标记物的变化模式。 ESC-胚胎干细胞; EGC-胚胎生殖细胞; ECC-胚胎癌细胞。阶段特异性抗原 （SSEA）
以往，用于作为mESCs，小鼠胚胎癌（ECS），或人EC细胞的标记物，被利鉴定未分化的人胚胎干细胞（hESCs） [,
] 。 在植入前阶段，小鼠胚胎，人类生殖细胞，和畸胎癌干细胞的膜表面表达被称为阶段特异性胚胎抗原（SSEA）的某些分子受体 [] 。 现在人们普遍认识到，SSEAs，鞘脂，被认为在识别具有多能和胚胎细胞表征的细胞中扮演者重要的作用。在卵子发生和胚胎形成期间，SSEA-3和SSEA-4在未分化的灵长类ESC，人胚胎生殖（EG）细胞，人畸胎癌干细胞，和ESC中表达 [] 。 目前，阶段特异性胚胎抗原-3（SSEA-3）和SSEA-4已被用来表征未分化的hESCs，而不是未分化mESCs [,
] 。 Frizzled （Fzd） and Cripto （TDGF-1）
Frizzled蛋白家族在小鼠和人类ESC中表达 [,
] 。Wnt信号通过将Fzd家族结合到Fzd和共受体-LRP5/LPR6来执行其功能，并最终激活的Wnt/β-catenin通路。Cripto-1对于早期胚胎发育起到关键的作用，并与小鼠和人ES细胞的未分化状态相关联。在发育过程中，Cripto是TGF-β配体，包括GDF1和GDF3的受体 [,
除了在胚胎形成期间具有至关重要的功能，作为一种致癌基因，Cripto在肿瘤中是上调的，并能促进肿瘤发生 [,
] 。 FFrizzled（FZD）蛋白包含由Wnt配体激活的跨膜受体（FZD1-10）家族。FZD9可以通过经典途径被Wnt 2和Wnt 8激活，通过非经典途径被Wnt 7激活。小鼠FZD9存在于发育中的大脑，发育中的神经管的神经前体细胞，和肌节。
转录因子在多能性维持中的重要本意义，可以清楚地以以下事实说明，通过诱导转录因子的表达，可以从小鼠胚胎成纤维细胞中获得多能干细胞。除了外在因素的影响，ES细胞的多能性也取决于内在因素，如POU转录因子的表达。因此，这些诱导的多能干细胞（iPS）是通过过表达一组特定的基因Oct4, c-Myc, Sox2, and Klf4来获得的。高丰度的Oct4，Sox2和Klf4使成纤维细重编程成具有多能状态的iPS细胞 [,
] 。任一Klf4或c-Myc与Oct4的组合足以从NSC产生iPS细胞。Oct3/ 4在多能干细胞中特异性表达。Sox家族基因与多能和单能干细胞相关。SOX1诱导iPS细胞效率与Sox2和SOX3相似，Sox 15 和Sox 18的效率有所下降。KLF5与Oct3/ 4和Nanog的转录，ESCs更新和多能性维持有关 [] 。
Klf4和KLF2能调节某些转录因子的表达：Nanog，Tcl1，Esrrb，Sall4，Tcf3，Mycn和Fbxo15 [] 。 Nanog是一种转录因子，并在小鼠和人ESCs的多能性和自我更新的维持中起着重要的作用，在ESC 分化时表达下调，这是与多能干细胞特性的紧密结合是一致的 [] 。 NNanog与多能ES和EG细胞，小鼠和人EC细胞有关。诱导PS细胞标记物
主要来说，完全重编程的人iPS细胞，与过渡期或不完全重编程的细胞相比，具有以下重要特点：（i）CD13表达下调，一种成纤维细胞标记物，（ⅱ）SSEA-4和 TRA-1-60表达上调，和其他多能性的标记物一样，（ⅲ）病毒转基因沉默，（ⅳ）Nanog内源性表达，（v）具有低Hoeschst截留能力或高Hoechst泵出潜力。完全分化的iPSCs的表达模式非常类似于正常或天然多能干细胞ESCs。例如，类似于在hESC中的表达模式，人类iPSCs也表达SSEA-3，SSEA-4，TRA-1-60，TRA-1-81，TRA-2-49 / 6E和Nanog。在基因表达和全基因组水平上，H3K4me3和H3K27me3与ES和iPS细胞极为相似。在小鼠中，iPCs表达在未分化的ESCs表达的基因，包括Oct-3/4, Sox2, Nanog, GDF3, REX1, FGF4, ESG1, DPPA2, DPPA4, 和 hTERT。与mESCs类似，小鼠iPCs细胞不表达SSEA-3和SSEA-4，但都正常表达SSEA-1。特化中的生殖细胞标记物
原始生殖细胞的前体细胞由E6.25期近端外胚层的4-8细胞发育而来，并表达转录抑制子Blimp1 [] 。过些时间，这些Blimp1阳性细胞连续增殖并在E7.5期开始表达Fragilis和Stella [] 。
图 1. 用来区别成年小鼠亚群的血细胞生成的不同阶段标记物的组合。长期造血干细胞（HSCs）具有很强的自我更新能力，并且在造血细胞等级的顶端也具有多向分化的能力。HSCs，造血系统的基础，具有产生造血系统的所有细胞类型的能力。短期HSCs是直接下游细胞，其具有相对有限的自我更新能力，但仍与多向分化能力。ST-HSCs下面是一系列造血祖细胞（HPCs），其具有越来越有限的分化和自我更新能力，并最后终末分化为成熟的造血细胞。虽然，多潜能祖细胞能够分化成所有类型的造血细胞，但缺乏自我更新能力。
PGCs最终引起E12.5期生殖嵴更多细胞的迁移和集群 [,
] 。 遗传和表观遗传协调发生的事件诱导PGC/生殖细胞形成雄性或雌性生殖细胞 [, ] 。 报告指出，ES细胞中的Blimp1, Stella, Fragilis, Piwil2, Dazl 和 MVH的表达， [, ], 说明ES细胞的起源可能是生殖细胞系。根据不同的阶段，某些标记物如Oct4，C-Kit在早期表达并在成熟生殖细胞系特化阶段前表达下调。如该示意图1，Tekt1和GDF9标记物仅在后期阶段被诱导表达。Nanos与从囊胚到成熟精子或卵细胞的所有发育阶段有关。外胚层和内胚层标记物
外胚层是非常早期胚胎的三个主要胚细胞层中的一个。其他两个层是中胚层（中间层）和内胚层（最近端层），外胚层作为最外部（或远端）层。某些因子标记外胚层，这包括Otx2, Chordin, p63/TP73L, FGF-8, Pax2. FoxJ3, Pax6, GBX2, SOX1, Nestin, beta- Tubulin, 和 Noggin。内胚层的形成依赖由成熟或未剪切的Nodal分别激活的Cripto和Bmp4/ Wnt3介导的两个连续的正反馈回路，维持Nodal信号从着床到原肠胚形成 [] 。酶和其他相关标记物系统
目前为止，除了我们讨论的，还有其他几种可用来进行干细胞鉴定和/或分离的标记物。这些包括基于酶（碱性磷酸酶和端粒酶）的反应，小分子（凝集素或短肽），和量子点（QD）或荧光染料等。这些标记物系统的详细介绍不在本篇综述的讨论范围内。蛋白质Uniprot登记号Gene ID数目排名前三供应商细胞表面多能性标记物oct4
（2）Nanog
4Abcam （1）,
（1）, ReproCELL （1）Sall4
（1）, Individual Researcher （1）Tbx3
（1）, Leica Biosystems （1）, BD Biosciences （1）Rif1
（2）CD349 / frizzled-9
（6）, Developmental Studies Hybridoma Bank （6）,
（4）Cripto-1
EssrbTRA-1-60TRA-1-81转录因子oct4
（1）c-Myc
1Life Technologies Corporation （1）Sox 15
4Abcam （1）,
（1）, ReproCELL （1）Tcl1
（1）, Leica Biosystems （1）, BD Biosciences （1）Sall4
（1）Fbxo15
PPPPP诱导多能干细胞标志物CD13
（1）SSEA-4
4Abcam （1）,
（1）, ReproCELL （1）SSEA-3
TRA-1-60TRA-1-81TRA-2-49/6E在规范生殖细胞标记物Blimp1
1Individual Researcher （1）Stella
（1）c-kit
（6）Tekt1
1Individual Researcher （1）Nanos
外胚层，内胚层的标记Otx2
（6）, Thermo Scientific Pierce Products （3）,
（3）FGF-8
6Covance （4）,
（2）FoxJ3
12Developmental Studies Hybridoma Bank （6）, Covance （3）,
（1）Nestin
（6）, Developmental Studies Hybridoma Bank （6）,
（4）beta- Tubulin
（7）Noggin
表 2. 主要的胚胎干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 造血干细胞标记物
造血干细胞（HSCs）是唯一，多能，自我更新的祖细胞，其负责连续供应骨髓和淋巴系的已分化的血细胞类型。这些细胞包括免疫系统的淋巴细胞，粒细胞，以及巨噬细胞，以及循环红细胞和血小板。HSCs具有两种重要的能力：（ⅰ）多能性-形成所有分化血细胞的能力，和（ii）长期自我更新-产生与祖先相同的子细胞的能力。HSC优先自我更新，这使HSC从多能祖细胞中被分离出，并负责在实验模型中能成功二次移植。使用造血干细胞（HSCs）的一个主要挑战是从较大的细胞库中鉴定和分离出来它们，是因为HSCs非常稀少，骨髓细胞的1/10，000，血液细胞的1/100，000 [] 。 形态学分析表明，HSCs在形态上类似于白血细胞。因此，ell表面标记物和分化抗原决定簇通常用来表征HSC的亚群。这也是一个公认的事实是，在成人骨髓中的HSC细胞表面标记物依据细胞周期状态和分化行为来进行动力学调节。 图 2. 生殖细胞标记物表达的时间轴。在每个生殖细胞发育阶段，一组生殖细胞标记物在确定时间点表达，来推动生殖细胞系的分化。在胚胎发育期间，原始生殖细胞（PGCs）的特化是对于生殖细胞系的发育是至关重要的，最终形成受精后的全能性受精卵。箭头指示标记物过表达的时期。
在1988年，Irving Weissman组分离了小鼠造血干细胞，还区分了鼠标长期（LT-HSC）和短期（ST-HSC）造血干细胞（具有自我更新能力），以及多能祖细胞 [] 。 最近，SLAM（信号淋巴细胞激活分子）家族的细胞表面分子成为另一种方法来纯化富集的造血干细胞。这个家族包括：CD48，CD150，CD244等。以下组合展现了显著的HSC亚群的区分模式，这些几乎表型相似，但在某些程度上有所不同。 LT-HSC : CD34-, CD38-, SCA-1+, Thy1.1+/lo, C-kit+, lin-, CD135-, Slamf1/CD150+ST-HSC : CD34+, CD38+, SCA-1+, Thy1.1+/lo, C-kit+, lin-, CD135-, Slamf1/CD150+, Mac-1 （CD11b）loEarly MPP : CD34+, SCA-1+, Thy1.1-, C-kit+, lin-, CD135+, Slamf1/CD150-, Mac-1 （CD11b）lo, CD4loLate MPP : CD34+, SCA-1+, Thy1.1-, C-kit+, lin-, CD135high, Slamf1/CD150-, Mac-1 （CD11b）lo, CD4lo淋巴系标记物
造血干细胞（HSC）可以分化成的两个主要的谱系，淋巴和骨髓系。常见淋巴祖细胞可以分化为所有淋巴系 [] 。 在淋巴细胞生成的过程中，淋巴系形成B细胞，T细胞，天然杀伤（NK）细胞，和树突状细胞。许多这些淋巴细胞生命是短暂的，并且免疫系统的稳态需要不断的HSC 自我更新和分化。这些标记物， c-KitLo, Sca-1 Lo, Lin- 和 IL7R+ 被用来表征淋巴系细胞。髓系标记物
常见的髓系祖细胞更能分化为祖细胞，其分别可以分化成粒细胞/巨噬细胞和巨核细胞/红细胞谱系 [] 。 在骨髓细胞生成的过程中，骨髓系发育成粒细胞，单核细胞，巨核细胞和树突状细胞。循环红细胞和血小板也从骨髓祖细胞发育而来。蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商CD48
（1）CD244
（2）, ImmunoTools （1）SCA-1
（5）Thy1.1
（2）C-kit
（1）CD135
Slamf1/CD150
（1）Mac-1 （CD11b）
（7）表 3. 主要的造血干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 肿瘤干细胞的鉴定与分离
日益明显的是，细胞表面标记物系统耦合FACS，是用于CSC分离和功能开发的最常用的方法。肿瘤干细胞表面标记物
不同的组织起源的肿瘤干细胞表面表达某些受体，即CD44，CD133，CD24，CD90，CD271，CD49f和CD13。在这些中，CD44，一种跨膜糖蛋白，是突出标记物之一，并已用于鉴定各种实体肿瘤的肿瘤干细胞。例如，正常膀胱上皮的基底细胞表达CD44，这正被用作标记用于膀胱的CSCs []. 同样，CD44以被证实与乳腺 [,
], 膀胱 [], 胰腺 [], 胃 [], 前列腺 [], 头颈部 [],
结肠癌 [], 卵巢 [] 的CSCs有关。
在结肠癌，敲除CD44削弱了其移植能力和直肠CSCs的体外克隆形成 [,
CXCR4现在正在使用在许多CSC模型中，包括胰腺癌模型。在这方面，只有CD133+ CXCR4+ CSCS可以形成远处转移，这暗示了CXCR4在癌细胞转移过程中有作用 [].癌组织起源细胞表面标记物参考文献CD44CD133CD24CD34CD38CD90CD117CXCR4SP胸OD [] 脑O [,
] 结肠O [] 肺O [] 卵巢OO [] 前列腺OO [] 前列腺OOO [] 胰腺O [] 鳞状细胞O [, ] 膀胱O [] 成神经管细胞瘤OD [] 表 4. 来自不同组织起源的肿瘤干细胞和其标记物系统。 ○：过表达; D：表达下调细胞角蛋白标记物
细胞角蛋白，中间丝，可以作为细胞分化不同阶段的上皮细胞的标记物系统。这些细胞角蛋白的表达依赖于上皮的类型，并且在正常上皮细胞的分化过程中它们的表达也会变化 [] 。 然而，细胞角蛋白是一类细胞内蛋白质，这不能通过用于CSCs分离的FACS检测。尽管有此限制，细胞角蛋白标记物可以提供宝贵的支持证据与标准标记物系统相结合，用来在实体瘤中分离干细胞，祖细胞和分化细胞 [] 。 其中最充分表征细胞角蛋白表达模式的是在皮肤，其中CK15表达仅限于隆起区域的多能干细胞，但被CK5代替 [] 。 分化进行中，CK5被CK10替换，最终被终端分化标记物外皮蛋白所替代 [, ] 。 现在可以理解的是CK14和CK5在泌尿道上皮基底细胞表达，CK8和CK18标志中间状态细胞，CK20仅在终末分化细胞中表示 [] 。 侧群细胞和乙醛脱氢酶（ALDH）
不仅用于肿瘤干细胞（CSCs）分离的细胞表面标记物得到普及，其他标记物也通常用于分离的CSCs。侧群细胞（SP）的区分实验就是鉴定某些CSCs。已知的是，SP分析依赖于具有ATP结合盒（ABC）家族的转运蛋白的独特功能的细胞亚群。该ABC通讯系统可以迅速外排染料Hoschst 33342，则形成该SP表型。SP群落得到富集并在很大程度上与CSCs重叠，已在许多癌症中鉴定出，如前列腺癌 [], 膀胱癌 [], 乳腺癌 [], 肺癌 [] 。乙醛脱氢酶（ALDH）方法被用于鉴定干细胞和CSCs [] 。鉴于正常和肿瘤干细胞都表达ALDH1，这种表达模式是表示乳腺癌患者的不良临床结果 [] 。ALDH标记物系统被利用来在胶质母细胞瘤，肺癌，肝癌和其他一些癌症中分离具有CSC性质的肿瘤细胞 [,
] 。蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商CD44
（4）CD133
17Miltenyi Biotec （7）, BD Biosciences （3）, Beckman Coulter （2）CD24
（2）CD271
（3）, Promega （3）,
（1）CD49f
（2）, Leica Biosystems （2）CK10
（3）, Covance （2）, Novus Biologicals （1）CK15
1Covance （1）CK8
12Developmental Studies Hybridoma Bank （3）, BD Biosciences （3）,
16Covance （5）,
（2）ALDH1
3Epitomics （1）, BD Biosciences （1）, Individual Researcher （1）表 5. 主要的肿瘤干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 心肌干细胞被认为是一个静止的心脏居民，可以在损伤如急性心肌梗死后重新进入细胞周期。心肌干细胞具有体外自我更新能力，体内分化为所有三种主要心肌细胞类型：心肌细胞，血管平滑肌细胞和内皮细胞的能力。具备识别和分析心肌干细胞的能力，研究人员有可能可以促进内源性心肌再生，防止充血性心脏衰竭。FLK1，血管内皮细胞生长因子受体，是侧板中胚层标记物，也是内皮细胞和血液细胞最早期分化的标记物 [] 。在这些中，Nkx2.5已知是早期心脏发育中心脏管的心肌细胞表达最多的蛋白 [] 。此外，本研究描述了FLK1 + CD31-VE-钙黏着蛋白亚群标志了心脏成血管细胞产生心肌细胞以及内皮细胞和造血细胞。hESC-MPs具有高表达的重要心肌转录因子：NKX2-5，MEF2C，HAND2和MYOCD；和细胞收缩因子：轻和重心肌肌球蛋白，ACTA2，ACTN1，TNNI或NCX1。研究表明，iPSCs细胞分化成心肌细胞，并表达TnTc, MEF2C, MYL2A, MYHCβ, 和 NKX2.5.。干细胞相关的基因在分化后表达下调 [, ] 。.
蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商CD34
（9）CD133
17Miltenyi Biotec （7）, BD Biosciences （3）, Beckman Coulter （2）α-SA
（9）TGF-β1
（3）c-kit
（3）CD105
（2）αMHC
（1）, Individual Researcher （1）cTnI
（1）connexin 43
（2）Nkx2.5
（3）Sca-1
（5）oct3/4
（1）SSEA-3
表 6. 主要的心肌干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 骨母细胞标记物
骨稳态的动态过程依赖于成骨细胞的沉积和骨细胞的吸收的平衡。成骨不仅负责骨组织不断重塑，而且对骨骼的大小，形状和完整性的维持至关重要。骨稳态的破坏伴随着一些病症，包括骨质疏松症，关节炎，和许多可遗传的骨骼疾病。细胞类型特异性标志物的开发是为了鉴定已分化成骨母细胞，成骨细胞，或骨细胞的间质干细胞。某些骨母细胞可以通过TGF-β，bFGF，BMP-2，和bFGF7860771|] 或gremlin 1 [] 的表达模式来区分。 此外，某些标记物像ALPP，MCAM，collagen I, collagen I alpha 1, collagen II, RUNX2, decorin, TPO 也可以使用。成骨细胞标记物
成骨细胞是构成骨外基质的骨骼肌细胞，特异地出现在胚胎期。转录因子Runx2，在未成熟的成骨细胞中表达上调，但在成熟的成骨细胞中表达下调。研究报告称，由Runx2确定的成骨细胞系，然而Sp7和经典Wnt信号传导是下调的，这决定了间充质细胞到成骨细胞的命运 [] 。Runx2触发了在成骨细胞分化的早期阶段的主要骨基质基因的表达，但Runx2对于成熟成骨细胞中这些基因的表达的维持不是必要的。一些相关因子也可作为成骨细胞标记物：碱性磷酸酶/ ALPP/ ALPI，骨钙素，BAP1，OPN，BAP31，osterix/ Sp7，I型胶原，SCUBE3，纤连蛋白，SPARC，和IGFBP-3 [,
] 。骨细胞标记物
骨细胞是骨中最丰富的细胞，微损伤引起的死亡是破骨细胞骨吸收启动的一个主要的原因。由于骨细胞分泌多种因子：TGF beta, RANKL, 和 MCSF，这可能会影响破骨细胞在被释放到髓间后的的招募功能 [] 。骨细胞产生硬化素，并与Wnt信号相互作用，从而抑制骨的形成 [] 。骨细胞也会产生DKK，作用于Wnt信号通路，抑制骨形成。 蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商Gremlin 1
（1）, Abgent （1）TGF-beta
（2）BMP-2
2Leica Biosystems （1）,
4Enzo Life Sciences （1）,
（1）Collagen I
（1）Collagen I alpha 1
（1）Collagen II
（2）, Developmental Studies Hybridoma Bank （2）RUNX2
（1）Decorin
1Abcysonline （1）成骨细胞标记物Runx2
（1）Alkaline phosphatase/ALPP/ALPI
2Leica Biosystems （1）,
（1）Osteocalcin
（1）BAP31
1Individual Researcher （1）Osterix/Sp7
Collagen I
（1）SCUBE3
1Fibronectin
（4）, Dako （3）SPARC
8Haematologic Technologies （2）,
（1）IGFBP-3
（1）骨细胞标记物TGF beta
（1）RANKL
（1）Sclerostin
（1）, Abgent （1）表 7. M主要骨母干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 肌原前体标记物
肌细胞生成是在胚胎期，当肌肉干细胞或成肌细胞增殖成多核肌小管时，肌肉组织的形成。在成年组织，肌肉衍生的干细胞是肌卫星细胞的一个独特群落，这促进损伤和疾病时肌肉的再生。在FGF和其他生长因子的存在下，成肌细胞增殖但不分化。缺失生长因子后，成肌细胞停止分裂并分泌纤连蛋白到细胞外基质，这促进了肌肉细胞融合的后续阶段。一种鸡尾酒标记物，包括肌原细胞标记物CD56，内皮细胞标记物UEA-1受体（UEA-1R），和血管周围细胞标记CD146，可以用来作为肌原前体标记物 [] 。分离和鉴定分化的平滑肌（VE-钙粘蛋白，α-平滑肌肌动蛋白），骨骼肌（FABP3，整合素α7），以及心肌（结蛋白，肌球蛋白重链）需要肌细胞生成的标记物。那些肌原标记物还是肌肉癌，退行性肌肉疾病和营养不良检测的重要工具。 蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商CD56
（4）CD146
4Enzo Life Sciences （1）,
（1）VE-Cadherin
（3）alpha-smooth muscle actin
（1）FABP3
Integrin alpha 7
1Novus Biologicals （1）Desmin
（12）, Epitomics （3）,
（1）Myosin Heavy Chain
1UEA-1 receptor （UEA-1R）表 8. 主要肌原前体细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 神经干细胞标记物
神经干细胞（NSCs）是具有自我更新，多潜能的独特细胞，负责形成神经系统的主要表型。神经干细胞具有独特的潜力，产生一旦分化就可形成克隆相关的子代；构成由神经元，星形胶质细胞，少突胶质细胞和室管膜细胞发育成的中枢神经系统。许多神经细胞类型的鉴定和分离使用细胞表面标记物的表达。CD133在 NSC的表面表达，并已广泛用于从人脑分离NSC [] 。CD15，胚胎特定阶段抗原-1，现在确定为小鼠室管膜下层（SVZ）的NSC和放射状胶质细胞的标记物 []. 。CD24被用作标记富集的NSCs [,
]. Peh等利用CD133，CD15和GCTM-2的组合，去从神经诱导培养物中富集神经球形成了 的NSC [] 。Golebiewska等以CD133 + / CD45- / CD34-标记物系统从分化的hESC中分离NSC [] 。Nestin和SOX-2作为有效的标记物，在中枢神经系统（CNS）的干细胞中表达显著，并参与神经干细胞的增殖和分化。除了细胞内分子，可用来研究的也表达在细胞表面，包括ABCG2，FGF R4和Frizzled-9。 蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商CD133
17Miltenyi Biotec （7）, BD Biosciences （3）, Beckman Coulter （2）CD15
（1）GCTM-2
2Individual Researcher （2）CD45
（8）Nestin
（6）, Developmental Studies Hybridoma Bank （6）,
（4）Sox-2
（2）ABCG2
（1）FGF R4
1Frizzled-9
表 9. 主要神经干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 间质干细胞标记物
间质干细胞（MSCs）是多能中胚层衍生的祖细胞，其能分化成脂肪，骨，软骨和肌肉组织，这提供范围广泛的治疗途径。成人间质干细胞可以从骨髓的基质中分离出来。MSCs表达一组主要的标记物，包括CD10，CD13，CD73，CD105和CD271。其他标记物包括CD140b，HER-2 / erbB2（CD340），frizzled-9（CD349） [] 。MSC从骨髓（BMMSCs）衍生来，是能够自我更新和分化成成骨细胞，软骨细胞，脂肪细胞和神经细胞的产后干细胞。研究报告指出，BMMSCs可表达重要因子：STRO-1，CD29，CD73，CD90，CD105，CD146，Oct4，和SSEA4。然而，BMMSCs不表达造血细胞标记物，尤其是CD14和CD34 []. 蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商CD10
（13）, Roche Applied Science （2）,
（3）, Individual Researcher （3）CD105
（1）CD271
（3）, Promega （3）,
（1）CD140b
（2）HER-2/erbB2 （CD340）
（21）, Leica Biosystems （7）,
（3）frizzled-9 （CD349）
（2）CD146
4Enzo Life Sciences （1）,
（1）SSEA4
STRO-1表 10. 主要间质干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。皮肤干细胞标记物
多能皮肤干细胞或表皮干细胞，在正常细胞的新陈代谢和伤口愈合期间，负责组织稳态。这种皮肤干细胞被发现驻留在毛囊内的适当位置。虽然，主要处在静止或慢细胞周期状态下，表皮干细胞是可以被刺激增殖和分化成能在伤口愈合过程中组成毛囊的专门细胞。K15蛋白的表达不仅标志表皮干细胞或祖细胞亚群，并标志表皮分化中的基底样细胞 [] 。最近研究表明，一些蛋白表达可以用来鉴定表皮干细胞，这包括CD34, Nestin, Follistatin, p63, Integrin alpha 6, Tenascin C, Frizzled因子 [] 因子。此外，还有其他几个关键蛋白P63，EGFR，IGFR，DELTA1，TBRII [] 。蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商K15
1Covance （1）CD34
（8）Nestin
（6）, Developmental Studies Hybridoma Bank （6）,
（4）Follistatin
（6）, Thermo Scientific Pierce Products （3）,
（3）Integrin alpha 6
（2）Tenascin C
（2）, Dako （2）Delta1
（1）TBRII
（7）, Vector Laboratories （1）Frizzled factors表 11. 主要皮肤干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 脂肪干细胞标记物
脂肪组织主要由脂肪细胞组成，这些细胞以形成脂滴来存储能量。此外，多能祖细胞，称为脂肪干细胞，可以由表达的标记物从脂肪组织中鉴定出来，标记物包括：整合素家庭，CD44和ICAM-1 / CD54。像间质干细胞，多能脂肪来源干细胞已经显示出在体外可分化成中胚层谱系，包括脂肪细胞，软骨细胞，成骨细胞，破骨细胞和成肌细胞。其他体外研究表明，脂肪干细胞具有额外的可塑性，并可转分化成其他胚层细胞，比如肝细胞和神经元样细胞。通常，脂肪来干细胞标记物（ASCs）是独特的粘附和受体分子，表面酶，细胞外基质和细胞骨架蛋白，和基质细胞表型相关蛋白。报告表明，ASCs的表面表型类似于骨髓来源的间充干细胞或基质细胞（MSCs） [] ，和骨骼肌来源的细胞。不过，唯一的例外可能是糖蛋白CD34，在人类ASCs存在，但不存在于MSCs。 蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商CD44
（4）ICAM-1/CD54
（8）Integrin family members表 12. 主要脂肪干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 肠干细胞标记物
现在人们普遍认识到，驻留在绒毛和隐窝间的多能肠干细胞能推动上皮细胞的的不断补充。肠干细胞或隐窝细胞，具有自我更新和肠道组织再生的能力，其通过分化所成各种肠道细胞，包括内分泌细胞，肠细胞，杯状细胞和潘氏细胞。Wang等人表明Lrig1参与维持肠上皮稳态和标记肠中的干细胞 [] 。最近的研究确定，LGR5作为一种新型的肠上皮和毛囊干细胞标记物 [] 。研究表明，一小部分的慢循环表皮SCs被定位于表皮的基底层。有一个有趣的研究是关于毛囊隆突区域内的标记滞留细胞。这些细胞被认为是静息的，并且在应力和损伤时可被诱导增殖 [] 。同样，Bmi1, Tert, Hopx 和 Lrig1也在LGR5（+）的肠干细胞中稳定表达 [] 。此外，肠干细胞表达BMI-1和TERT [,
] ，肠网状干细胞能产生肠间质鞘并表达gremlin 1 []. 蛋白质Uniprot登记号基因IDNum排名前三供应商Gremlin 1
（1）, Abgent （1）Lrig1
5Epitomics （1）,
（1）, Leica Biosystems （1）Hopx
表 13.主要肠干细胞标记物，和其抗体用来免疫组织化学，免疫细胞化学，流式细胞术和ELISA的被引用次数，以上由来邦网从出版物中调查获得。 卵巢和输卵管干细胞标记物
Lgr5是多种上皮细胞的干细胞标记物，最近显示可作为卵巢和输卵管上皮的干/祖细胞的标记物 [] 。
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