工具类服务
编辑部专用服务
作者专用服务
转录组测序深度对表达基因检测影响的初步研究
随着新一代高通量测序技术的迅猛发展，RNA-Seq技术已成为目前转录组研究的重要手段，而转录组测序深度直接影响表达基因的检测。本文基于RNA-Seq测序技术，研究了测序深度对表达基因检测的影响，为不同研究目的而选择合适的测序深度提供了参考。本文以人类脑组织的转录组测序数据为分析材料，建立了完整的RNA-Seq数据分析流程，首先对FASTQ格式的测序数据进行质量评估和过滤处理，然后从过滤后的数据中随机取样，模拟构建了不同测序深度的文库，最后分析了所有数据，并比较分析了不同测序深度下检测到的基因数量的变化。研究发现，随着测序深度的增加，检测到的基因数量也随之增加，但新增检出的基因个数随着测序深度的增加而逐渐减小，两者并不是简单的线性关系，其关系形如：y= a· log2(x+b)+c，其中，x,y分别表示测序深度和检出的基因数，a，b，c为常系数。同时，本文还讨论了测序深度对检测转录因子、长链非编码RNA表达的影响。
学科专业：
授予学位：
学位授予单位：
导师姓名：
学位年度：
在线出版日期：
本文读者也读过
相关检索词
万方数据知识服务平台--国家科技支撑计划资助项目（编号：2006BAH03B01）(C)北京万方数据股份有限公司
万方数据电子出版社关注今日：12 | 主题：107370
微信扫一扫
扫一扫，下载丁香园 App
即送15丁当
转录组测序数据分析的问题--为什么要做GC含量分布图
页码直达：
这个帖子发布于4年零283天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
各位见笑了，我刚刚接触分子生物学，一个很外行的问题，转录组测序后为什么要做基因的GC含量分布图？
不知道邀请谁？试试他们
微信扫一扫
广告宣传推广
政治敏感、违法虚假信息
恶意灌水、重复发帖
违规侵权、站友争执
附件异常、链接失效
关于丁香园苹果/安卓/wp
& 附件下载
转录组测序数据分析小软件介绍.pdf
游客无法下载，
熟悉论坛请点击&&&&nbsp
经管之家APP：通过论坛APP下载，免流量费，哇！ &
1.下载一个附件当天只会扣除您一次下载次数和一次流量费。
2.论坛支持迅雷和网际快车等p2p多线程软件下载，请在上面选择下载通道&&单击右健下载即可（不会算多次下载次数）。
3.论坛会定期自动批量更新下载地址,所以请不要浪费时间盗链&&论坛资源,盗链地址会很快失效。
4.本站为非盈利性质的学术交流网站,网站资源仅供&&教学、研究使用,请下载后24小时内自行删除。()
哇!统计软件还可以这样学!!!
视频教学+名师在线互动+权威答疑
你也可以成为统计高手
囊括所有常用统计软件培训：
、、、、、、、、等
联系方式：曾老师
: training@pinggu.org
无限扩大经管职场人脉圈！每天抽选10位免费名额，现在就扫& 论坛VIP& 贵宾会员& 可免费加入
&nbsp&nbsp|
&nbsp&nbsp|
&nbsp&nbsp|
&nbsp&nbsp|
&nbsp&nbsp|
&nbsp&nbsp|
如有投资本站或合作意向，请联系（010-）；
邮箱：service@pinggu.org
投诉或不良信息处理：（010-）
京ICP证090565号
论坛法律顾问：王进律师}