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ITS序列分析在真菌分类鉴定和分子检测中的应用
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真菌的分子生物学鉴定方法
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3秒自动关闭窗口rDNA-ITS序列分析在真菌鉴定中的应用--《中国卫生检验杂志》2008年10期
rDNA-ITS序列分析在真菌鉴定中的应用
【摘要】：目的:通过对3株真菌的rDNA-ITS序列进行分析,以探讨、说明基于核糖体RNA基因(即rDNA)内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)的多态性的序列分析(rDNA-ITS序列分析)在真菌鉴定中的应用。方法:通过PCR扩增与测序的方法测得待检真菌菌株的rDNA-ITS序列,从GENBANK获取相似序列,使用BLAST和DNAMAN工具对rDNA-ITS序列进行比对分析。结果:1号真菌菌株与Xylariales sp.LM40(属炭角菌目)同源性高,但尚不能鉴定到具体的属、种;2号真菌菌株可鉴定到种,为草酸青霉P3号真菌菌株可鉴定到种内组水平,为近平滑假丝酵母III组(最新命名为Candida metapsilosis)。结论:相对于传统的真菌形态学鉴定方法,rDNA-ITS序列分析用于真菌鉴定更客观、省时、简便、快速,但目前也存在一定的应用限制(受基因库的完善程度、高度同源性序列的多少以及具体物种ITS区的可变程度等影响)并不能鉴定出所有真菌,宜与传统的形态学鉴定方法相结合用于真菌鉴定。
【作者单位】：
【关键词】：
【基金】：
【分类号】：R450【正文快照】：
真核生物基因组中编码核糖体的基因包括28S rDNA、5SrDNA、18S rDNA和5·8S rDNA 4种,它们在染色体上头尾相连、串联排列,相互之间由间隔区分隔。其中18S、5·8S和28SrDNA基因组成一个转录单元(图1),三者高度保守,适合于较高等级水平的生物群体间的系统分析[1],其间的间隔区
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