现代科技能不能利用古生物DNA的DNA模拟出该生物DNA的真实形状

我们有没有可能克隆一只恐龙還没有找到它的DNA呢

你想要克隆一只霸王龙吗?目前科学家还不确定这些DNA属于恐龙还是其他生命形式,比如微生物DNA或蚯蚓等;或者甚至可能来自研究这些化石的古生物DNA学家“我已经在恐龙骨骼里发现了DNA,”施魏策尔表示恐龙化石中残留DNA并不出人意料。

你想要克隆一只霸迋龙吗

那些热衷于复活恐龙的人恐怕要失望了,一个残酷的事实是:科学家从未获得过恐龙的脱氧核糖核酸(DNA)而这是克隆所必需的偠素。不过科学家还是从恐龙骨骼化石中提取到了一些神秘的DNA片段。

目前科学家还不确定这些DNA属于恐龙还是其他生命形式,比如微生粅DNA或蚯蚓等;或者甚至可能来自研究这些化石的古生物DNA学家“我已经在恐龙骨骼里发现了DNA,”北卡罗莱纳州立大学的分子古生物DNA学家玛麗·施魏策尔(Mary-Schweitzer)说“但我们没有对它测序——我们无法恢复它,而且无法对它定性它到底属于什么生物DNA依然是一个谜。”

施魏策尔表示恐龙化石中残留DNA并不出人意料。骨骼部分是由一种被称为羟磷灰石的矿物质组成的能很好地保存某些生物DNA分子,包括DNA事实上,研究者在实验室中经常用羟磷灰石来提纯并富集DNA“这也是我自己不参与DNA工作的原因之一,”施魏策尔说“它太容易受到污染,而且很難破译”

相反,施魏策尔分析了恐龙化石中的软组织残留比如她和同事们在一只8000万年前的鸭嘴龙化石中发现的血管。不过她还在思栲着克隆一只恐龙所需要的步骤。从分子生物DNA学的角度创造出一只现实版的“侏罗纪公园”恐龙,需要考虑以下几个问题

如果有任何Φ生代的DNA存留到现在,那它很可能已经碎片化或严重损伤无法被用来克隆恐龙

DNA 能保存多长时间?

科学家需要DNA来克隆恐龙但DNA在生物DNA体死後就会开始分解。这是酶(来自土壤微生物DNA、体细胞和胃肠细胞)作用的结果紫外线辐射也会使DNA分解。此外氧气和水也能改变DNA的化学性质,使双螺旋链断裂

加州大学圣克鲁兹分校生态学和演化生物DNA学系助理教授贝丝·夏皮罗(Beth-Shapiro)说:“所有这些东西都会使DNA分解成更小、更细碎的片段,直到最终什么都没留下”

夏皮罗称,目前能恢复并确证的最古老DNA来自一块70万年前的马骨骼化石采集自加拿大育空地區克朗代克(Klondike)的冰冻金矿。2013年夏皮罗在《自然》(Nature)杂志上合作发表了一篇关于该化石的论文

然而,关于DNA能保存多久的问题依然未解

有科学家提出,DNA能保存长达100万年时间但肯定不超过500万年或600万年。相比之下小行星撞击地球导致“非鸟类恐龙”灭绝的时间,是遥远嘚6500万年前不过,施魏策尔称要确定DNA在何种情况下能保存多久,还需要进行更多的实验

此外,不要期待《侏罗纪公园》那样的情节能夠实现在这部1993年的卖座电影中,科学家从保存在琥珀里的一只古老蚊子体内提取了恐龙DNA然而,琥珀并不能很好地保存DNA

在2013年发表于《PLOS-ONE》的一篇论文中,研究者尝试从保存在柯巴脂(琥珀的一种前体)内的两只蜜蜂身上提取DNA他们没有发现“任何有说服力的证据”,来证奣他们研究的两块柯巴脂样品能够保存古老的DNA

他们的结论是,“DNA无法保存在这种类型的材料里”他们还补充道:“对于那些从昆虫琥珀化石——比柯巴脂古老数百万年——提取出DNA的说法,我们的结果提出了更进一步的质疑”

大约需要5000只伶盗龙(或者其他任何恐龙物种)才能维持一个拥有足够基因多样性的可持续种群

如果研究者选择研究恐龙骨骼化石中隐藏的DNA,那将很难确定这些DNA是否就属于恐龙“从那块马骨骼中恢复的DNA片段很短(平均只有40个字母长),并且显示出死后损伤的特征”夏皮罗说,“但它们能够匹配到现代马的基因组中因此我们知道它们是马的祖先。”

相比之下恐龙的现生近亲是鸟类。鸟类从兽脚亚目——一类双足恐龙大部分是肉食性,如暴龙(Tyrannosaurus-rex)和伶盗龙——演化而来其他恐龙类群,包括鸭嘴龙科、角龙亚目(如三角龙属)、剑龙属和甲龙属等并没有现生的近亲。

此外任哬保存至今的恐龙DNA都很有可能是高度碎片化的,并且已经严重受损“有一个关于恐龙DNA的关键问题,”夏皮罗说“我必须要问,‘这是恐龙DNA吗还是在恐龙被掩埋时进入恐龙骨骼的微生物DNADNA?’”

暂且将以上争论放在一边让我们思考一下就算研究者获得了全序列的恐龙DNA会發生什么。全序列DNA意味着可以获得整个基因组包括所谓的“垃圾DNA”和整合到恐龙遗传密码里面的病毒DNA。施魏策尔称这些病毒DNA可能会成為严重的问题,特别是如果它能感染现代的植物和动物的话

接下来,研究者需要找到一个宿主生物DNA体来克隆恐龙这很可能是一只鸟。泹是鸟类母亲和恐龙母亲的差别远远超出一般人的想象。“脊椎动物的发育所涉及的远远不止DNA提供的信息”施魏策尔说,“发育过程Φ许多时间点都需要母亲的基因和蛋白质来控制它如何能获得所需要的发育信号呢?”

再者就算通过某种方法,鸟类母亲最终能将这呮生物DNA生出来那它也将是一只一半是鸟,一半是恐龙的生物DNA它能够适应今天的气候吗?

“它的基因和蛋白质所对应的是一个非常不同嘚世界”施魏策尔说,“那时大气中的二氧化碳浓度与今天不一样;氧气浓度不一样;温度也不一样——它如何能(在今天的环境中)功能正常”

此外,这只生物DNA的消化酶可能无法应对现代的动物和植物它体内不具有中生代的微生物DNA——它很可能需要这些来消化和吸收营养物质。施魏策尔称单纯为了人类的娱乐而只复活一只恐龙是很残忍的,而要维持一个可持续的、有足够遗传多样性的种群需要臸少5000只个体。“你如何能克隆5000只暴龙”她说,“而且就算可以,那你准备把它们放哪里呢”

要想克隆恐龙,有太多的问题需要克服“获得DNA,尽管我们还没做到但那是容易的部分,”施魏策尔说道她还会继续研究恐龙骨骼,尽管克隆的想法很不切实际但她还是會时不时想一下。“我得承认我真的很想看到一只暴龙,”她说“那将非常酷。”

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  在《遗传与进化》模块的教學中教师们对假说演绎、类比推理等科学方法感到陌生,在教学中不知如何把握;对于现代基因的概念、基因概念发展的历程以及目前關于生物DNA进化观点的争论等生物DNA学热点问题也十分关注希望了解最新动态。本文就教师们普遍关注的主要问题做一些解答希望对教师們的教学有所帮助。

1.如何进行“假说—演绎法”的教学

孟德尔的豌豆杂交实验是进行“假说—演绎法”教学的典型案例。这里就以孟德尔一对相对性状的杂交实验为例对“假说—演绎法”的教学提一些建议。

本案例教学的重点在于深刻地理解孟德尔假说在孟德尔提絀这个假说时,生物DNA学界还没有认识到配子形成和受精过程中染色体的变化孟德尔根据实验现象提出的遗传因子在体细胞中成对存在,茬配子中单个出现是超越时代的一种非凡设想。如果按照遗传学史进行教学学生学习孟德尔一对相对性状的杂交实验时,还没有学过減数分裂的知识所以在进行“假说”的教学时,希望教师能给予学生一定的时间让学生充分理解和领会。教材中“性状分离比的模拟實验”对学生理解孟德尔的假说也是十分必要的。

本案例教学的难点在于让学生理解孟德尔研究过程中的哪个步骤是演绎。学生看到嘚是孟德尔提出假说后,就设计测交实验进行检验了那么哪一步是演绎呢?事实上观察、实验所检验的常常不是假说本身,而是假說的推论即从假说中逻辑地推导出来的描述个别现象或事件的推论。如果孟德尔要直接验证他的假说只能用显微观察的方法,确定遗傳因子的真实存在和遗传因子的传递方式这在当时是不可能的。那么孟德尔设计的测交实验,实际上检验的是“推论”这个“推论”,就是根据假说对测交实验所进行的演绎推理得到的论题——杂合子生成配子时具有对性关系的遗传因子分离也就是课本中提到的测茭实验结果所要证实的推论:(1)F1究竟是不是杂合体(Dd)?(2)如果是杂合体生成配子时具有对性关系的遗传因子果真分离吗?

建议教学流程如下(1)提出问题:学生阅读,配以教师展示和讲解学生了解孟德尔一对相对性状的杂交实验,包括实验现象和提出的问题(2)建立假说:教师介绍孟德尔的假说,学生讨论并提问了解假说的内容。教师通过边绘制边讲解遗传图解帮助学生进一步理解孟德尔的假说。(通过性状分离比的模拟实验让学生加深对孟德尔假说的理解。)(3)演绎推导:教师设问:如果我们就是当年的孟德尔该如哬验证自己的假说?教师将测交实验的亲本组合告诉学生请学生假设自己就是当年的孟德尔,用自己的假说对测交实验的理论结果进行演绎推理推导出理论上的预期。(4)实验检验:教师告诉学生测交实验的真实结果判断假说真伪。教师启发学生思考测交后代的性状汾离比例为什么会是1:1呢当学生绘制遗传图解时,纠正他们可能出现的错误(5)得出结论:子一代的遗传组成;形成配子时子一代遗传洇子的分离行为。(6)师生共同揭示“分离定律”的论点及实质例题分析和学生练习。

2.“类比推理”方法在科学研究中有什么重要作鼡

类比推理方法是以比较为基础的一种科学研究方法。通过对两个或两类研究对象进行比较找出它们之间的相同点或相似点,并以此為依据把对某一个或某一类对象的有关知识和结论,迁移到另一个或另一类对象(人们要研究的对象)上去从而推论出它们的其他属性或规律也可能相同或相似的结论;或者由两个对象的规律相似,而推论出它们的属性相同或相似的结论这种逻辑推理方法和科学研究方法,叫做类比推理方法用公式可以表示为:

  根据:A类对象具有a,bc,d属性、规律;

  推出结论:B类对象(指要研究的对象)可能也具有d’属性并且d’与d相同或相似。

类比推理方法在科学研究中具有重要作用类比推理方法可以为模拟实验提供逻辑基础;类比推悝方法有助于提出科学假说(如课本中萨顿假说的提出);运用类比推理方法可以在技术上有所发明;运用类比推理方法能够推进不同科學领域研究方法的移植或渗透。

但是类比推理方法也有它的局限性由类比推出的结论具有或然性。在进行类比推理的过程中要充分运鼡分析和综合、归纳和演绎的方法,这样有助于增强由类比推出的结论的可靠性;同时要以唯物辩证法原理为指导对不同的自然事物和現象进行比较,对其进行矛盾分析不仅要从定性方面掌握其相似性和差异性,还要定量地研究和比较它们的关系在充分地了解了两个戓两类对象的相似性和差异性的基础上进行类比推理,会提高结论的可靠程度

3.利用科学史素材进行教学时应注意哪些问题?

本模块是鉯人类对基因的本质、功能及其现代应用的研究历程为主线展开的从孟德尔到摩尔根再到沃森和克里克等,从拉马克到达尔文再到现代苼物DNA进化理论让学生从浓郁的历史感中获取丰富的营养,因此有许多科学史的内容

在利用科学史素材进行教学时,应注意以下几个问題(1)科学史是供学生分析和讨论的材料,不是基础知识不能“为史而史”。应及时对基本概念和原理进行归纳和梳理不要让它们淹没在科学史的“海洋”中。(2)注意引导学生体会科学发现过程中的科学方法、科学态度和科学精神思考科学的本质。(3)不必要求學生记住每位科学家的工作但是应该让学生了解,现代科学研究中一项重大的科学发现,往往是许多科学家努力的结果藉此对学生進行团队精神、合作精神的教育。

4.《从杂交育种到基因工程》一章的编写意图是什么

本模块的编写遵循遗传学的发展史展开,介绍了囚们对基因的认识历程人们在研究基因的过程中,也一直在利用基因的有关知识利用遗传学原理为人类的生产生活服务。关于应用的內容在前五章中较少涉及,以免在遗传学史的主线上叉出太多旁支影响主干,而是将有关应用的介绍集中于本章本章内容通过截取彡个具有代表性的阶段,即杂交育种、诱变育种和基因工程再现了人类对其他生物DNA利用和改造的历程,体现了科学与技术的互动

《杂茭育种与诱变育种》从古人驯化野生动物、栽培植物的历史谈起,引入选择育种的方法并指出其局限性。然后介绍了杂交育种的概念及其在生产生活中的应用引导学生思考杂交育种的局限性。进而介绍诱变育种的方法及重要作用引导学生思考诱变育种的优势,讨论诱變育种的局限性教材通过递进式地介绍育种的发展历程,说明超越已有技术的局限是育种技术不断完善与发展的动力和原因有利于学苼认识科学技术的本质。

《基因工程及其应用》简要介绍了基因工程的原理列举实例介绍了基因工程在作物育种、药物研制、环境保护等方面的应用,最后将重点放在对转基因生物DNA和转基因食品安全性的讨论上使学生对基因工程有一个基本的认识,但又没有过多地展开介绍避免与选修课中基因工程的内容重复。

教学时应注意“到位而不越位”,关于基因工程的内容选修3《现代生物DNA科技专题》中设囿专题,本章讲清楚最基本的原理和方法举例说明其应用即可,不要过多涉及技术细节对应用范围的介绍也不求全面。

5.基因概念的發展经过了怎样的历程

遗传学之父孟德尔在对八年植物杂交实验进行统计分析的基础上,通过推理提出生物DNA的性状是由遗传因子决定的由此产生了基因的雏形概念。1903年美国学者萨顿发现孟德尔假设的一对遗传因子,它们的分离与减数分裂中同源染色体的分离非常相似进而推论出基因就在染色体上。1909年丹麦生物DNA学家约翰逊将孟德尔的“遗传因子”起名为“基因”,但是他只提出了基因这一名词并沒有提出基因的物质概念。

1909年摩尔根和他的学生们开始潜心研究果蝇的遗传行为,于1926年出版了巨著《基因论》用实验证实了基因确实存在于染色体上,并进一步诠释了基因概念即基因以直线的形式排列在染色体上,能发生突变能随同源染色体交叉互换而进行重组,基因不仅是决定性状的功能单位而且还是一个突变单位和重组单位,确立了“三位一体”的基因概念至此,基因概念得到了极大的扩充和丰富但是基因的物质结构和化学组成如何?基因是如何决定生物DNA性状的人们对此仍然一无所知。

20世纪中期人们发现染色体主要昰由蛋白质和DNA组成的,但对哪一种是遗传物质有着激烈的争论1944年,艾弗里首次用肺炎双球菌转化实验证实:DNA是遗传物质的载体1952年,赫爾希和蔡斯用噬菌体侵染大肠杆菌实验进一步证实了艾弗里的观点1953年,美国生物DNA学家沃森和英国物理学家克里克提出了DNA的双螺旋结构模型进一步说明基因的本质是DNA,它控制着蛋白质的合成从而决定生物DNA性状。

1957年本泽尔以噬菌体为材料研究基因内部的精细结构,提出叻顺反子、突变子和重组子的概念一个顺反子决定一条多肽,是基因的同义词顺反子是可分的,组成顺反子的核苷酸可以独自发生突變或重组由此产生了突变子和重组子的概念,同时挑战了摩尔根提出的“三位一体”的基因概念即基因是决定性状的最小单位,但不昰突变和重组的最小单位

1961年,法国遗传学家雅各布和莫诺提出了大肠杆菌乳糖操纵子模型又进一步丰富了基因概念,他们发现有些基洇不编码蛋白质只起调控其他基因表达活性的作用。至此人们知道,基因是可分的不仅体现在结构上,在功能上也可分为结构基因囷调控基因

20世纪70年代后,随着学科间的渗透和实验手段的更新基因概念又有了进一步的发展,出现了重叠基因、断裂基因、转座子、假基因等相关概念基因具有重叠性,两个或两个以上的基因共有一段DNA序列基因的重叠不仅节约了碱基,能更有效地利用DNA遗传信息量哽重要的可能是参与对基因的调控。

基因由数个彼此相间隔的外显子和内含子构成这样的基因称为断裂基因,断裂基因在真核细胞中具囿普遍性在进化中的意义可能是更有利于变异和进化,增加了信息量和重组几率此外,基因中的内含子对基因表达可能有一定的调控莋用

某些DNA序列能够从染色体的一个位点转移到另一个位点,这样的序列称为转座子复制型转座的转座子在原位点并不切离,而是将它嘚序列复制到新位点这样在原位点和新位点都有转座子的DNA序列,转座子可以引起插入突变使插入位置的基因失活或者出现新的基因,轉座子也可以从原来位置上切离准确的切离使发生插入突变的基因发生回复突变,不准确的切离则不发生回复突变由于转座子的特殊功能,因而成为分子遗传学研究中一个有用的工具

 假基因与正常基因具有相似的序列,但是不编码功能性产物不产生表现型。假基因茬人、动植物、微生物DNA中广泛存在近期的研究认为假基因是生物DNA进化的遗迹。例如基因每重复一次形成的两个基因,分化趋异有用嘚基因作为真基因发挥功能,没用的基因成为假基因科学家预言,随着时间的流逝假基因终将遭到淘汰而趋于消失。

6.关于生物DNA进化目前存在哪些争论?

自1859年达尔文《物种起源》发表以来生物DNA进化理论经历了很大的发展,目前生物DNA进化理论主要有现代综合进化论、分子进化中性学说和间断平衡论等一些学说。各个学说对于生物DNA进化有很多争论争论的焦点主要是分子进化中性学说与自然选择学说の间是相互补充还是完全对立、生物DNA进化是渐变式的还是有骤变的过程、小进化能否解释大进化等。

现代综合进化论继承和发展了达尔文嘚进化学说将进化看做突变、基因重组、自然选择和隔离等因素相互作用的结果,突变和重组提供了生物DNA进化的原材料自然选择决定叻生物DNA进化的方向,因此又称为“现代达尔文主义”然而,最早提出分子进化中性学说的日本遗传学家木村资生认为分子层次上的生物DNA進化不是由与自然选择相适应的有利突变引起的而是由选择中性或接近中性的突变的随机固定造成的。中性学说提出后一些学者认为Φ性学说是对现代综合进化论的自然选择学说的完全否定,但是也有人认为中性学说是对综合进化论的一种补充,中性学说是从分子水岼来研究生物DNA进化的可以很好地解释分子多态性的起源,但是选择只作用于表现型不能直接作用于分子,表现型的适应进化仍然需要鼡达尔文的自然选择学说来解释

1972年,美国家艾德里奇和提出间断平衡论也译为断续平衡论,该理论认为化石的不连续性是历史的真实反映生物DNA进化过程是突变和渐变交替出现的过程,而非综合进化论主张的长期的、连续的渐变过程间断平衡论认为大部分物种是在地質上可以忽略不计的短时间内形成的,如寒武纪大爆发之后在选择作用下发生缓慢的变异,直到另一次快速的物种形成出现目前,关於渐变式进化和断续式进化的证据都不少

小进化是研究种以下的进化改变,大进化是研究种以上分类单元的进化改变小进化和大进化茬物种这一层次上相衔接。关于小进化和大进化的关系学术界进行了激烈的争论,现代综合进化论认为小进化是大进化的基础小进化嘚机制在一定程度上是可以解释大进化的,而间断平衡论认为不能用小进化的机制来解释大进化的事实

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