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主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升每3.6 个
螺旋上升一圈,向上平移0.54nm故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm螺旋的方向为
R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的
氧和第㈣个N-H形成氢键氢键的方向与螺旋长轴基本平行。由于肽链中的全部肽键都可形成氢键故α-螺旋十分稳定。
主链绕假想的中心轴盘绕成螺旋状一般都是
与多肽链C端方向的第4个残基(第4+n个)的酰胺氮形成氢键。在古典的右手
结构中螺距为0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸
每个残基沿着螺旋的长轴上升0.15nm。
②螺旋形成是自发的肽链骨架上由n位
起着稳定的作用;被氢键封闭的环含有13个原子,因此α螺旋也称为3.6/13螺旋;
③每隔3.6个残基螺旋上升一圈;每一个氨基酸残基环绕
为0.54nm,即每个氨基酸残基沿轴上升0.15nm;螺旋的半径是0.23nm;Φ角和Ψ角分别为-57°和-47°;
④α螺旋有左手和右手之分,但蛋白质中的α螺旋主要是
团位于螺旋的外侧并不参与螺旋的形成,但其大小、
却能影响螺旋的形成和稳定
,螺旋-转角-螺旋等基序中都含有α-螺旋这是因为α-螺旋的直径为1.2nm,正好和
大沟的直径相等所以能够和
中断,产生“结节”Pro的
的形成,使α-碳原子—N键不能旋转
更大,所以大多α-螺旋起始或中止于Gly还有
较大的氨基酸相邻时影响生成两个“α-碳上分支”(α-碳原子上除了H,还有两个其他基团接在上面如Thr,Ile(ile)
3.带相同电荷的氨基酸相邻,使α-螺旋趋于解体
α螺旋的稳定性不仅取决于肽链间的氢键形成,而且还取决于肽链的氨基酸侧链的性质。试预测在室温下的溶液中下列多聚氨基酸哪些种将形成α-螺旋哪些种形成其他的囿规则的结构,哪些种不能形成有规则的结构并说明理由。(1)多聚亮氨酸pH=7.0;(2)多聚异亮氨酸,pH=7.0;(3)多聚精氨酸pH=7.0;(4)多聚精氨酸,pH=13.0;(5)多聚谷氨酸pH=1.5;(6)多聚苏氨酸,pH=7.0;(7)多聚脯氨酸pH=7.0。
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