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&A类错误cif求解
A类错误cif求解
作者 yy0520yy
帮忙看看！
DENSX01_ALERT_1_A&&The ratio of the calculated to measured crystal density
& && && && &lies outside the range 0.80 && 1.20
& && && && &Calculated density =& && &1.229
& && && && &Measured density& &=& && &0.000
SHFSU01_ALERT_2_A&&The absolute value of parameter shift to su ratio & 0.20
& && && && &Absolute value of the parameter shift to su ratio given& &1.154
& && && && &Additional refinement cycles may be required.
PLAT026_ALERT_3_A Ratio Observed / Unique Reflections too Low ....& && && &12 Perc.
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && & 0.94& && &
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................& && & 1.15& && &
PLAT053_ALERT_1_A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...& && && & ?
PLAT054_ALERT_1_A Medium&&Crystal Dimension Missing (or Error) ...& && && & ?
PLAT055_ALERT_1_A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...& && && & ?
PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as .& && &mixed
[ Last edited by sanko211 on
at 10:14 ]
Measured density& &=& &&&？ 不填数值（如果测定了的话，就填上，原来为0.00不对）
继续精修，多修几轮，使其收敛，第二个问题就消除了
第三个问题不好解决，可能晶体质量差或空间群定错
完整度低于95%，在ins文件中ACTA 50可获得最大完整度，你是一下，这也说明晶体较差或空间群有误
下个问题和第二个问题相同
在ins文件中加上命令SIZE 后跟晶体大小
把mixed改为contr，
抱歉，刚才打字错了，最后一条中漏掉了字母s，应为constr
一楼是正解 你试一试用IMIT啊
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && & 0.94&&
太低了，试一下omit -3 50
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&一个氨基酸配合物晶体解析，cif文件出现3个A 类错误，求助
一个氨基酸配合物晶体解析，cif文件出现3个A 类错误，求助
作者 alixy2
最近测了个氨基酸配合物晶体，反复解析总是出现三个A类错误，如下：
Alert level A
PLAT213_ALERT_2_A Atom C8 has ADP max/min Ratio ..... 10.6 oblat
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 10.0 Ratio
PLAT770_ALERT_2_A Suspect C-H Bond in CIF: C8 -- H2 .. 1.70 Ang.
请问这些提示说明了什么问题？有什么办法解决这三个A类错误？
是不是结构有部分无序的？
引用回帖:: Originally posted by huahua1216 at
是不是结构有部分无序的？ 好像的确是有些无序。这样怎么处理了？
引用回帖:: Originally posted by alixy2 at
好像的确是有些无序。这样怎么处理了？... 那就把需要统计的基团处理好 一般c上的氢理论加就好，
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&【求助】checkcif 后出现的A类错误，请高手帮忙！
【求助】checkcif 后出现的A类错误，请高手帮忙！
作者 来去自由86
在checkcif 后出现下面这三种A类错误，请各位高手帮忙，这些是什么错误，应该怎么处理？谢谢各位了。
1.Large Non-Solvent H Ueq(max)/Ueq(min) ... 10.00 Ratio
2.Angle Calc 106.7(3), Rep 120.4(6), Dev.. 45.67 Sigma
&&C60 -C59 -C61 1.555 1.555 2.530
3.Torsion Calc -128.2(5), Rep -2.2(10), Dev.. 252.00 Sigma
& &C61 -C59 -C60 -C61 2.530 1.555 1.555 1.555
你的结构没有解完，看看有没有溶剂什么的
第一个应该是有的原子热振动大导致的 后两个是不是对称代码或者什么的搞错了
你的晶体还没有解析完好，最好重新解析一下，用platon看看空间群有没有问题，一些基本的参数达到基本要求了没有，总之处理的差不多了再进行check，否则一切都是没用的，不能对症下药，
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高金求助大神，CIF A 类错误已有1人参与
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C41& &&&is N.P.D. or (nearly) 2D ...& &&&Please Check
PLAT213_ALERT_2_A Atom O20& && && && & has ADP max/min Ratio .....& && & 22.6 prolat
PLAT213_ALERT_2_A Atom C28& && && && & has ADP max/min Ratio .....& && &&&7.7 prolat
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact&&O14& & ..&&O28& &&&..& && & 2.44 Ang.
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PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C41& &&&is N.P.D. or (nearly) 2D ...& &&&Please Check
PLAT213_ALERT_2_A Atom O20& && && && & has ADP max/min Ratio .....& && & 22.6 prolat
PLAT213_ALERT_2_A Atom C28& && && && & has ADP max/min Ratio .....& && &&&7.7 prolat
这三个说相应各个方向原子温度因子差的太多了，可能有无序，part处理一下。
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact&&O14& & ..&&O28& &&&..& && & 2.44 Ang.
这个说两个氧之间距离太近了，仔细检查一下结构对么。
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高金求助大神，CIF A 类错误
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PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C41 is N.P.D. or (nearly) 2D ... Please Check
PLAT213_ALERT_2_A Atom O20 has ADP max/min Ratio ..... 22.6 prolat
PLAT213_ALERT_2_A Atom C28 has ADP max/min Ratio ..... 7.7 prolat
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact O14 .. O28 .. 2.44 Ang.
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