如何用酒精沉淀法回收pcr产物测序

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【求助】小片段亚克隆回收效率如何提高?
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这个帖子发布于8年零335天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
做了几个一百多bp不到200bp小片段的T载体,现在正在往目的载体上搬,但是回收效率实在让我头疼,具体情况是这样的:1)t载体大概3k,小片段都不到2002)由于买到的内切酶包括takara和neb两家的,不好混用,所以双切分两次做,也就是说要回收两次。作了几次,不断加大初始质粒的用量,可是一次回收,总量就少掉3分之2,两次后几乎就回收不到小片段了。。。。不知道takara和neb两家的内切酶是否能够混用,这样做一次回收,酶切体系和回收得率感觉都能优化一下。。。
不知道邀请谁?试试他们
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第一次回收你也是跑胶?用乙醇沉淀损失不了多少的此外第一次回收还可以用PCR回收试剂盒,几乎不损失而且片断小做连接时候用量就少,一点点就够了。
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有道理。。。第一步可以用pcr纯化盒子代替胶回收。。。
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不知道你是怎么想的,赶紧把酶统一公司,时间永远比金钱重要,然后双酶切,直接酶切产物过柱回收,我用的是BBI的,生工最近打的特价的。然后和胶回收的载体连接。(这里有个小窍门:你可以将小片段先连到和你目标载体抗性不同的载体上,这样只要你目的载体酶切完全,根本不必考虑假阳性)祝你好运!
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阿,谢谢阿,因为实验室原来就有不同厂家的酶,老板又觉得这是个小case,我前面也只好这么做了,花了好久还是没有能够做好,胶回收效率实在不怎么样,定量也不方便,最后几十微升一溶解,好大一个体系好低一个浓度。。。埃,决定统一酶体系了!
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最后溶解干吗加那么多水?最多加十几二十就足够了。再狠点干脆直接把连接体系往干燥的片断里面加,肯定够用
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汗,博大的kit用水洗效果不佳,以后再也不用水了,把连接体系往干燥的硅胶柱上加我还没想好后果会怎样。。。现在打算1)按原方案用洗脱缓冲洗脱看看能不能改善一下状况2)重新订统一的酶。。。
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想试试看第一步酶切用氯仿抽再用无水乙醇沉淀然后回收,这样似乎可以免去切胶过柱的损失,然后第二轮酶切再用胶回收,最后还是用乙醇沉淀浓缩体系,达到所需的浓度。。。。。。。orz我要去实践一下!
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我以前连的片段一个88 一个90bp,建议不要用T载体,直接连接表达载体会好一些,从上载体切下来的目的片段肯定比PCR的少,而且难回收.
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改用无水乙醇沉淀出来的,损失大概一半,不过溶解后的质量不错。继续尝试中。。。
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不同公司的酶是可以混用的,实际上,我从来就不考虑酶的来源。我甚至经常用两种Takara的酶作双酶切,但buffer使用NEB公司,也可能用Takara和NEB的酶,buffer使用Fermentas公司的,算如今也应该是身经百战了吧,但还没有在这方面发生问题。
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恩,我同学也干过,已经作好随时统一品牌的准备了。话说neb的bglII切的效率好像不是很好,50ul体系十几个小时总是切不完全。。。
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chilling 做了几个一百多bp不到200bp小片段的T载体,现在正在往目的载体上搬,但是回收效率实在让我头疼,具体情况是这样的:1)t载体大概3k,小片段都不到2002)由于买到的内切酶包括takara和neb两家的,不好混用,所以双切分两次做,也就是说要回收两次。作了几次,不断加大初始质粒的用量,可是一次回收,总量就少掉3分之2,两次后几乎就回收不到小片段了。。。。不知道takara和neb两家的内切酶是否能够混用,这样做一次回收,酶切体系和回收得率感觉都能优化一下。。。为什么两个公司的酶不能一起用?或者按照Takara的,或者按NEB公司的,完全可以共用的。我就这么做过,除非在同一个公司提供的buffer里找不到合适的,才会分两步酶切。我建议你还是一起酶切,看一下酶在buffer中的效率,只要最低效率&50%即可,这样可以大大节省时间。
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你这个还是小问题啊 我回收50bp左右的才是郁闷到自杀。快死了
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用好的回收试剂盒,德国MN的产品,65bp以上的片断回收效率达到90%,不好不要钱。李辉平
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丁香园中级站友
这个回收小片断,我还比较在行,我以前的片断只有100bp市售的试剂盒常常有小片断回收效率很低的问题。PCR产物经过酶切、回收等步骤后,损失太大。进入连接反应的PCR片断量太小常常是试验失败的原因。我的做法是,简化步骤、减少核酸在处理过程中的损失,让较多量的PCR产物和质粒片断进入酶连反应——以量取胜。我的做法是很粗放型的,但是成功率很高。如果愿意,你可以试试。大致的做法是:制作100微升PCR产物;酒精沉淀回收PCR产物;PCR产物及载体酶切;跑回收胶;将回收胶上的PCR产物和载体片断切下,回收到一个试管中;冰冻、碎胶,酚、氯仿抽提,酒精沉淀;加入8微升水、1微升连接酶和1微升连接buffer,4度过夜;转化涂板。具体的操作:PCR产物回收1. 制备100μL PCR产物。2. 将100μL PCR产物加入一1.5mL离心管中,再加入400μL双蒸水,颠倒混匀。加入 900μL 预冷 无水乙醇、20μL 3M的醋酸钠。颠倒数次混匀。(提示 本方法使用的醋酸钠量较小,但足够沉淀核酸,并且无需洗盐。)3. 4℃静置30分钟,以利于核酸沉淀。4. 12000rpm 4℃ 离心15分钟,沉淀核酸。5. 弃上清,将离心管倒置于干净吸水纸巾上5分钟。室温下吹风干燥。(提示 可将试管至于超净台吹风干燥。如果管底有较多液体聚集,可盖好管盖后,轻弹管底数次,将液体分散挂在管壁上,再打开管盖吹风。)酶切直接在回收PCR产物的试管中配置酶切体系:PCR产物酶切-制作插入片断10×Buffer 6μLSal I 5μLPCR产物 —— 双蒸水 49μL合计 60μL要将PCR产物接入的质粒载体A,取A质粒(小提的质粒即可)3μL进行酶切。A质粒酶切-制作载体片断10×Buffer 3μLSal I 1μL质粒 3μL双蒸水 23μL合计 30μL混匀。37℃,酶切3小时。1%琼脂糖回收胶回收(碎胶、酚氯仿抽提法)1. 酶切产物加入10%量的上样Buffer,混匀。使用1%的琼脂糖回收胶,电泳回收酶切产物。2. 用手术刀切下所需要的大片断(载体)和小片断(插入片断),收入一个1.5mL离心管中。 (提示 切胶前,需用分别含酒精、NaOH和双蒸水的纸巾擦拭凝胶接触的台面,以防污染。 手术刀要火焰消毒,而后切胶回收。)3. 12000rpm 1分钟,将凝胶甩到管底。 -20℃ 冰冻20分钟。4. 取200μL Tip 头两只,在酒精灯上稍烤化Tip头尖端,两Tip头尖相对来回相接触,在Tip头顶部制成直径3mm左右的平头,准备用于碎胶。5. 从-20℃取出冻结的凝胶,立即使用200μL枪套上平头Tip头,捣碎凝胶。(提示 200μL的枪足够粗壮,不要用100μL的枪,小心折断!!! 乘凝胶比较硬时就开始碎胶,轻而频率高地捣碎凝胶。胶碎裂不够细密可再次冰冻后碎胶。)6. 凝胶管中加入500μL双蒸水,盖紧,振摇200下。7. 加入500μL Tris饱和纯酚,盖紧,振摇200下。 12000rpm 4℃ 离心15分钟。8. 在一新1.5mL 离心管中加入 500μL 氯仿:异戊醇(24:1),将步骤7的上清加入本步骤离心管中。盖紧,振摇200下。 12000rpm 4℃ 离心5分钟。9. 在一新1.5mL 离心管中加入 900μL 预冷 无水乙醇、20μL 3M的醋酸钠。将步骤8的上清小心加入本步骤离心管中。颠倒数次混匀。12000rpm 4℃ 离心15分钟。(提示 吸取步骤8中的上清时,千万不要将有机相吸入,宁可放弃一些上清,否则影响后面的连接反应。 另外,本方法使用的醋酸钠量较小,但足够沉淀核酸,并且无需洗盐。)10. 弃上清,将离心管导致于干净吸水纸巾上5分钟。室温下吹风干燥。(提示 可将试管至于超净台吹风干燥。 如果管底有较多液体聚集,可盖好管盖后,轻弹管底数次,将液体分散挂在管壁上,再打开管盖吹风)连接向回收DNA的试管中加入8μL 双蒸水,盖紧,弹击管底使液体尽量接触管壁。瞬时离心将液体甩到管底,再加入1μL ligase Buffer,1μL T4 ligase(连接酶)。弹击管壁混匀,瞬时离心将液体甩到管底。 置4℃过夜。 (提示 Ligase Buffer应该在首次融解后分装,每管可2-3μL,-20℃存储。 4℃过夜可获得最多的转化克隆。)目前我用的最好的是TAKARA的D301试剂盒我后面把说明书发来.CLONTECH的NucleoTrap Gel Extraction Kit用3M 的NaCl或NaAc将回收胶浸泡过夜,然后用乙醇沉淀,就可以了。0mega我刚做了100bp的回收,回收率能达到40%。以下几点建议:1 尽量用新配制的TAE,(有人说TBE效果不好),但我用的是TBE2 Qiagen说100bp片段在溶胶后要加入异丙醇,但我发现容易产生沉淀,堵柱子。但我不知Omega用的是什么溶胶液,你可以试一下:溶胶后加入与胶等体积的异丙醇,如用0.1g胶,加100ul异丙醇,再进行一下操作3 回收的样品尽量上样多一点,我一般是用4ug/100ul其实我没有用Qiagen的盒子,只是看了他的说明书。一般说来,各个公司的溶胶液中用的都是NaClO4,这种溶胶液加入异丙醇产生絮状沉淀,堵柱子。你试一下Omega的看看行不行?其实最早的凝胶回收文献是在PNAS 1979的文章,用的是NaI,现在一般不用了,有毒。古老的方法不好,如果Omega的盒子加入异丙醇沉淀的话,用尽量多的产物上样,总能得到一点纯化的带,够用就行了。我做100bp,上样量4ug/100ul,最后用50ul水洗脱,回收率达10%,0.2ug/50ul,足够用了。片段太小,很难操作,是不是可以试试如下策略:引入外源基因扩大PCR产物长度进行克隆,外源基因可以选取克隆载体上的片断,在其多克隆位点之外(复制子下游非必需区)的一个酶切位点之间的序列(再设计一条引物),用60bp的PCR产物和质粒做模板再进行PCR,获得包含60bp和部分载体序列连接的序列,然后再酶切克隆。当然中间的引物要合成一个5‘与载体序列一致的。没做过,只是想法,供参考!Qiagen gel kit can facilitate your job.荐华舜的胶回收试剂盒回收效果好,经常回收完了只跑1微升电泳就能看到很浓的条带说说我的吧,我是将胶割下来,然后放到用21-规格的针头戳个孔的0.5ml管,将其至于1.5ml的管中,最大速度离心将胶断裂成小的,然后加TE溶液在65度作用2小时,或4度过夜,然后吸取溶液用乙醇,0.5倍体积的7.5M NH4Ac 沉淀,最好能加点肝糖原,效果停好的,我回收130和34bp的都这样,不烦试试!如果你的PCR产物比较纯,可以直接沉淀。推荐一种PEG8000沉淀法,适用于浓度0.1ug/ml,长度26bp以上片段:加入0.01倍DNA样品体积的1mol/L 氯化镁;加入0.5倍DNA样品体积的 40% PEG8000,混匀;室温沉淀10分钟12000g室温离心10分钟。70%乙醇洗涤,12000g室温离心5分钟;同样条件再次洗涤。重悬这样,关于核酸回收,建议不用国产的,当我们拆开用于吸附的柱子看看,一切就都明白了,国产的就是30-50层滤纸,而进口的就是尼龙棉柱,这就是根本区别,吸附为基础的柱子是因为沉淀的核酸有与尼龙柱特异结合的特性,这是胶回收,PCR回收,和质粒提取盒子的关键。而国产柱子为了降低成本尤其是小公司自制的柱子,(最近就有一个北京的试剂商在我们科研究核酸回收试剂盒,叫梁平,四川人,不知北京战友有没有人认识),就是用滤纸代替尼龙柱,用超滤拦截沉淀的核酸分子,你想,这不是胡闹么,滤纸哪能截得住分子?这就是造成国产核酸柱子回收率降低的根本原因。我也拆了几个国内公司的核酸回收试剂盒的柱子,不看不知道,一看吓一跳,全都是滤纸,只是有的层多一些有的层少一些。就没有一个是尼龙柱。尽管Omiga是立陶宛的公司,质量也稍微差劲,但是人家用的就是尼龙柱。进口核算回收柱我最喜欢Roch的,效率很高。Gibico的也还可以。也有战友说进口的柱子回收率也不高,原因在哪里呢?关键步骤:1,溶胶要充分2。温度不能太高,&50C后磷酸基团自发脱落,会导致后续步骤的连接困难3。结合缓冲液,(含异丙醇,也有的试剂盒异丙醇后加),一定要反应充分,确保核酸彻底沉淀,异丙醇可以加过量,可以将试管在桌面上敲一敲,如果还有气泡产生就是反应不够充分,还应继续反应,直至没有气泡出现为止。4。洗涤缓冲液中的乙醇一定要过量,使用时间长了乙醇要挥发,一定要酌情添加,否则,洗涤的时候,核酸就溶在洗涤缓冲液中丢了。5。溶解缓冲液的量和PH值是否足够?有没有在室温下将其充分溶解?玻璃奶试剂盒从低熔点凝胶提取DNA。纯化DNA片段 加与凝胶体积相等的TE(10mmol/l Tris-HCl pH8.0,0.1mmol/l EDTA),置65℃水浴5分钟保温,使凝胶完全溶解。待放至室温,加等量酚(TE饱和,TE封在上层,取下层酚),轻轻混匀(不用混匀),12000rpm,3分钟离心。反复1-2次。取上层液,加0.1体积3mol/L醋酸钠(pH5.2)和2.5倍体积无水乙醇,进行乙醇沉淀。将纯化的DNA加适量TE溶解,测定含量,备用(可用于目的基因结构分析,探针制备等)。除低熔点凝胶回收法外,如用一般凝胶可用透析带短暂电泳,离心管低部加玻璃棉,高速离心等方法回收DNA片段。用低熔点胶电泳后切下含目的带的胶条,置液氮中处理几分钟,捣碎胶块,加入一定量的TE溶解之,再用酚/氯仿抽提取上清沉淀即可。试剂盒回收若要提高大片段的回收率需要加入异丙醇。
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版大发的这个太厉害了!!!可以精华了!!!!
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关于丁香园如果pcr产物电泳结果不单一,怎么改善和提高实验质量
如果pcr产物电泳结果不单一,怎么改善和提高实验质量
09-10-21 &匿名提问
RACE技术的简介 cDNA完整序列的获得对基因结构、蛋白质表达、基因功能的研究至关重要。 完整的cDNA 序列可以通过文库的筛选和末端克隆技术获得。 末端克隆技术是20世纪80年代发展起来的。RACE(rapid-amplification of cDNA ends)是通过PCR进行cDNA末端快速克隆的技术。 RACE的优点 与筛库法相比较,有许多方面的优点 1)此方法是通过PCR技术实现的,无须建立cDNA文库,可以在很短的时间内获得有利用价值的信息。 2)节约了实验所花费的经费和时间。 3)只要引物设计正确,在初级产物的基础上可以获得大量的感兴趣基因的全长。 实验室现有的RACE试剂盒的简介 RACE是一种从一个相同的cDNA模板进行5‘和3‘末端快速克隆的方法。此方法会产生较少的错误条带。此过程中使用的酶混合物非常适合长链PCR。 使用此方法的要求是必须知道至少23-28个核苷酸序列信息,以此来设计5’末端和3‘末端RACE反应的基因特异性引物(GSPs)。 RACE引物的设计: 基因特异性引物(GSPs)应该是: 23-28nt 50-70%GC Tm值≥65度,Tm值≥70度可以获得好的结果 需要实验者根据已有的基因序列设计5‘和3‘RACE反应的基因特异性引物(GSP1和GSP2).由于两个引物的存在,PCR的产物是特异性的。 反应中涉及到的一些事项 cDNA的合成起始于polyA RNA。如果使用其它的基因组DNA或总RNA,背景会很高。 RACE PCR的效率还取决于总的mRNA中目的mRNA的量和不同的引物有不同的退火和延伸温度。 在进行5‘和3’RACE PCR的时候应该使用热启动。 表4中给出了所有引物的相互关系。重叠引物的设计会对全长的产生有帮助。另外,重叠的引物可以为PCR反应提供一个对照。并不是绝对的要利用设计的引物产生重叠片段。 引物GSP中的GC含量要在50-70%之间。这样可以使用降落PCR。避免使用自身互补性的引物序列,否则会产生回折和 如果要用重叠片段来检测设计的引物,GSp1和GSp2之间至少是100-200碱基。只有这样才可以用扩增的产物来鉴定设计的引物是否正确。 降落PCR可以明显的增加RACE PCR产物的特异性。在最开始的循环中,退火温度高于AP1引物的Tm值,可以增加对特异性条带的扩增。随后的退火和延伸的温度降回到AP1的温度,可以进行随后的PCR循环。 形成分子内氢键。另外,避免使用与AP1互补的引物,尤其是在3‘末端。 验证基因特异性引物的对照: 单个引物的阴性对照:只用一个引物GSP来进行阴性对照。这样不应该产生任何的条带。如果可以看到明显的产物,应该改变循环的参数,或重新设计原始引物。 利用两个GSPS进行阳性对照:(只有两个GSP可以产生重叠的时候才可以采用此步。)为了确定RNA样品中目的基因确实表达,利用两个GSP和接头连接的cDNA来产生阳性对照。可以产生两个引物之间的重叠大小的片段。如果没有这个片段,应该重复cDNA的合成,或者从一个不同的组织或细胞来源进行cDNA的合成。 制备和抽提polyA RNA 不要使用DEPC处理过的水。 纯化完mRNA之后,利用琼脂糖凝胶电泳检测mRNA的质量。哺乳动物的mRNA样品是0.5-12kb的拖带,在其中有4.5和1.9kb的rRNA的条带。非哺乳动物的mRNA应略小。 具体的实验步骤 cDNA第一条链的合成: 我们建议进行cDNA合成的对照反应,这样可以对样品的cDNA的合成进行鉴定。加入各种试剂之后,在气浴中42度保温一个小时。 注意: 在水浴或酒精浴中保温回减少反应体积,从而降低第一链的合成效率。 将管放于冰上,以终止第一链的合成反应。 直接进行第二链的合成。 cDNA第二链的合成: 第二链合成的酶混合物中,含有聚合酶、RNaseH和连接酶。T4 DNA聚合酶的功能是补平dscDNA的末端。我们建议做阳性对照,试剂盒中提供人类骨骼肌的mRNA。 建议进行阳性对照,cDNA的质量取决于制备的polyA RNA的质量。非哺乳动物样品的mRNA大约在0.5-3kb之间。 通过电泳检测cDNA的产量,与对照进行对比,这样可以有利于在以后的步骤中对cDNA进行稀释。 接头的连接及连接产物的稀释 按照程序进行连接反应。 如果没有对比样品和对照的产量,利用Tricine-EDTA buffer制备接头连接的ds cDNA的1/50和1/250的稀释物,用两种稀释物进行以下的RACE PCR反应,直到鉴定出哪一种稀释可以得到好的效果。 RACE-PCR扩增 进行5’和3’的RACE-PCR扩增。 利用以下的程序进行降落PCR反应: 注意: 我们建议使用降落PCR反应,这就要求GSP的Tm值≥70度。 当循环结束时,利用1.2%琼脂糖凝胶电泳分析每一个管中的产物5μl,使用适当的分子量marker。 可以根据你的基因的特异性来设计最理想的循环参数。如果看不到带或者只有微弱的带,在68度多加5个循环。最佳的延伸时间取决于扩增条带的长度。如果片断的长度在2-5kb的时候,经常使用4min,0.2-2kb的时候将延伸时间减到2-3min,对于5-10kb的条带,延伸时间增加到10min。 RACE产物的验证: 应该对RACE的片段进行验证,以此来确定是否已经扩增了理想的产物。如果得到的是多条带或者研究的是多基因家族的成员,验证是非常有用的。 有3种验证RACE产物的方法: (1)比较由GSP和NGSP获得RACE产物。 (2)Southern blot (3)克隆并测序 我们建议最好测得RACE产物的部分序列。有的时候需要嵌套引物的存在。 比较由GSP和NGSP获得RACE产物 对于5‘末端的RACE产物,比较由AP1和GSP1扩增出来的产物和由AP1和NGSP1扩增出来的产物。 对于3‘末端的RACE产物,比较由AP1和GSP2扩增出来的产物和由AP1和NGSP2扩增出来的产物。这对于鉴定多条带是否是上一个PCR的特异性产物是非常有用的。 如果条带是正确的,在嵌套PCR反应中的条带应该是略微小一些。基本PCR和嵌套PCR产物的迁移率的不同取决于cDNA结构中GSP1和嵌套引物的位置。 RACE产物的克隆和测序: 可以利用胶回收试剂盒来回收RACE产物,此试剂盒适合回收2.5kb以下的RACE产物;对于长的片段,可以通过电洗脱获得好的结果。如果你选择使用其他的纯化方法,最后用Tricine-EDTA buffer 30μl重新悬浮DNA样品。 电泳5μl回收的样品来鉴定回收的质量。 将回收的PCR产物直接克隆到/A型的PCR克隆载体中。另外还可以利用接头和/或cDNA合成引物中的Not1、Srf1、Xma1、ECOR1等酶切位点,将产物克隆到常规载体中. 对于5‘端的RACE产物,我们建议挑取至少8-10个不同的克隆以获得5‘端的最大可能性的序列。(反转录并不总是进行到mRNA模板的5’末端,尤其是长模板。另外,T4 DNA聚合酶会移走5‘末端的0-20个碱基。) 一旦鉴定了含有插入片断的克隆,应该获得多的序列信息。理想的是,可以对整个开放读码框进行测序。包括5‘和3‘的非翻译区。 全长cDNA的获得 通过部分或全部测序鉴定了RACE产物后,可以通过两种选择获得全长的cDNA。 通过PCR的方法获得全长cDNA: 扩增长的cDNA需要较长的延伸时间,但是如果延伸的时间过长,可以产生拖带,所以要慎重的设计引物。 根据从5‘和3‘RACE产物获得序列信息设计5’和3‘GSP引物。这些引物应该来自cDNA的3’或者5‘的末端,应该是23-28nt长。不应该在引物的末端加上限制性位点,这样会导致高背景。在某些时候可以设计3’和5‘的嵌套引物。但是还是应该先利用一对引物进行PCR反应。 进行如下的热循环: 94度 30秒 25个循环 94度 5秒 72度 2-15分钟 延伸的时间应该等于预期的cDNA长度加上2分钟。例如:预期得到6kb的条带,用6+2=8分钟的延伸时间。 注意:如果没有条带或者条带弱,增加5个循环;或者优化PCR的条件。 在1.2%的琼脂糖凝胶上分析5μl的样品。通常情况下,可以见到一条单一带,如果这样,利用胶来纯化全长的cDNA。 制备1.2%的TAE buffer制备琼脂糖凝胶。不使用TBE buffer,TBE的胶很难制备全长的cDNA。 将剩下的45μl反应物点样,选用适当的marker。 利用长波紫外观察cDNA(≥300nm)切下全长的cDNA。注意:应该尽量减少紫外对cDNA的照射。 利用胶回收试剂盒回收cDNA。此试剂盒适合回收2.5kb以下的RACE产物;对于长的片段,可以通过电洗脱获得好的结果。如果你选择使用其他的纯化方法,最后用Tricine-EDTA buffer 30μl重新悬浮DNA样品。 将全长的cDNA克隆到T/A型的 PCR克隆载体中。
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我想用乙醇沉淀法纯化pcr产物,求助份具体步骤?谢谢查看完整版本请点击这里:
birdfish ( 10:43:26)
不喜欢用苯酚和氯仿,用的另一种方案:
加1/10的3N醋酸钠,再加3倍量无水乙醇,冰浴30min,13600rpm离心20min,弃上清.加75%乙醇,再离心20min,弃上清,真空干燥,加水溶解。
BUK ( 10:43:44)
离心时间越长回收率越高,尤其是小片段。
ending ( 10:44:04)
这种方法好用吗,与跑胶再胶回收的方法相比有什么优点
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抗人乙酰胆碱受单链抗体1956#的可溶性表达、纯化及其功能鉴定.pdf68页
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标题: 如何用乙醇沉淀连接产物和胶回收的线性DNA?(连接产物,胶回收)
摘要: [如何用乙醇沉淀连接产物和胶回收的线性DNA?(连接产物,胶回收)] 请教大家:怎样用乙醇沉淀连接产物和胶回收的线性DNA?谢谢! 关键词:[连接产物 胶回收]……
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回复你这句话不太通顺。回复怎样用乙醇沉淀胶回收的线性DNA载体?还有怎样沉淀重组载体?回复你的DNA都胶回收了,还乙醇沉淀干什么啊?保存?回复用宝试剂盒连DNA和线性载体,它建议把试剂盒的胶回收DNA再乙醇沉淀,去处盐质连接后我要做电转
请问怎么做回复用宝试剂盒连DNA和线性载体,它建议把试剂盒的胶回收DNA再乙醇沉淀,去处盐质连接后我要做电转
请问怎么做回复胶回收的时候可以不用试剂盒带的溶解Buffer,直接用超纯水溶解洗脱即可,不用考虑盐分,回收效率一致。如果要乙醇沉淀回收,直接向你的体系里加2V的无水乙醇(或95%乙醇)和1/10V的3M的NaAc(pH5.2),混匀静置,12000g离心10min,70%酒精洗涤沉淀两遍,晾干酒精,超纯水溶解即可。要注意的是,乙醇沉淀的时间不要太长,低温(有利于DNA,特别是小片段的沉淀,一般可以控制在-20度)静置,10min之内离心收集沉淀,否则盐分也会沉淀很多;另外,70%乙醇漂洗要严格一点,要彻底把沉淀打起来,以为这步就是洗盐的。另外,我不太清楚电转化对质粒的离子强度要求是否有这么严格,一直都没有特意的去除盐,我直接连接产物电转都没关系的啊
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