DNA提取dna纯度检测测的OD260/280为什么定在1.8?原理?

毅新兴业为您提供从实验设计到数据分析一整套专业的科技服务!
&&&&&&&为您提供从实验设计到数据分析一整套专业的科技服务!
我们提供的结果报告可用到您发表的文章中。
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
蛋白组学解决方案
差异蛋白发现和鉴定
&&&&&&&差异蛋白质组学是蛋白质组学研究的一个重要内容,其核心在于寻找由某种特定因素在细胞、组织或生物体内引起的蛋白质表达差异,揭示并验证表达差异的蛋白质在生理或病理过程中的变化。在进一步对蛋白质组差异信息分析后,理论上可以推断出引起这种变化的原因。因此,对于疾病的诊断、药物靶标的寻找、细胞调控分子的鉴别等多方面的研究有着重要的意义。毅新兴业拥有目前最为前沿、全面的差异蛋白发现和鉴定技术,为您提供最周到的服务,满足您的科研需求。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
液体蛋白芯片指纹图谱
&&&&&&&液体蛋白芯片指纹图谱解决方案(CLINPROT™)由美国哈佛大学医学院与美国休斯敦贝勒医学院于2003年共同研究开发,2004年正式呈现给全球的医学研究者。利用CLINPROT系统可发现潜在的生物标志物(biomarkers),并能够鉴定单个的生物标志物。
&&&&&&&CLINPROT系统以MALDI
TOF/TOF质谱系统为基础,把样品分离、质谱分析和生物信息学相结合,克服了2D电泳的缺点,为差异蛋白的发现提供了新的途径。与普通蛋白质组学不同的是,临床蛋白组学研究的主要目标是寻找疾病相关的蛋白生物标志物。CLINPROT解决方案简单、重复性强、通量高,分离低丰度蛋白效果尤其显著,充分适应临床蛋白质组学研究的要求。
1.差异蛋白的发现
&&&&&&&患者或健康对照的临床样品,如血清、血浆、尿液、脑脊髓液等,首先通过磁珠分离,去除样品中的高丰度蛋白和其他杂质,如盐等,同时富集低丰度蛋白。分离后得到的样品中加入基质,混合后直接点在AnchorChip靶上,进行飞行时间质谱分析,得到所有蛋白的质谱图,通过软件比较患者或健康对照的差异表达蛋白,得到两者的特异质谱谱图,用于预测未知样品的归属-患者或无疾病。
血清(20μl,无絮状物,无溶血发生)
差异蛋白发现
血清(有絮状物等)
差异蛋白发现
项目服务(两组血清,每组25个样品)
差异蛋白发现
芯片选择服务(两个样品、三类芯片)
差异蛋白发现
其他样品如体液、尿液、脑脊液等
差异蛋白发现
2.差异蛋白的鉴定
&&&&&&&我们联合中国军事医学科学院、中国人民解放军总医院、中国农业大学功能基因组中心,精心打造蛋白鉴定套餐,采用差异蛋白鉴定的多种技术手段,包括MALDI TOF/TOF、Q-TOF、FT、离子阱等,为您鉴定各种复杂性和难易程度不同的样品。
血清(20μl)/
鉴定片段≤4000Da
差异蛋白鉴定
血清(100-500μl)经芯片提取物的多肽混合物/
鉴定片段≤4000Da
差异蛋白鉴定
血清(100-500μl)经芯片提取物的多肽混合物/
鉴定片段≤10000Da
差异蛋白鉴定
3、差异蛋白模型的建立(服务编号:BYPB):
&&&&&&&采用标准流程,通过对肽质量指纹图谱(PMF)等质谱数据进行差异分析,寻找差异特征;采用包括人工神经网络、基因算法等多种模型算法,建立三组相应疾病的预测模型并从优选择其中一组。在模型建立完成后,根据应用的目的,提供针对科研领域和临床领域的不同验证方案,进行模型外部验证。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
2D GEL双向凝胶电泳
&&&&&&&双向电泳(Two-dimensional electrophoresis,2D)是研究蛋白质组学的一种经典方法,它可根据蛋白质的等电点和分子量在一块胶上分离出几千种蛋白质,是蛋白质组学研究的主要方法之一,和质谱技术一起成为鉴定蛋白质差异表达的重要手段。
&&&&&&&DIGE是在传统2D的基础上,结合了多重荧光分析的方法,在同一块胶上同时分离多个分别由不同荧光染料标记的样品,极大地提高了结果的准确性、可靠性和重复性。DIGE技术可检测到样品间小于10%的蛋白表达差异,统计学可信度达到95%以上。 &
[服务内容]
&&&&&&&我们提供从样本处理到图像分析的全套双向电泳解决方案,同时可提供荧光差异蛋白表达分析系统(DIGE)升级方案供您选择。在传统双向电泳技术的基础上,结合多重荧光分析的方法,极大地提高了结果的准确性、可靠性和重复性。
1、样品制备:
蛋白质的提取
血清高丰度蛋白质的去除(可选)
视具体情况决定
SDS-PAGE(7cm)
2、双向电泳:
等电聚焦(IEF)
胶 条 平 衡
3、2D-DIGE
样品处理/标记
样品标记后1D预试验
图像分析(差异点分析)
4、图像处理分析 服务编号: BYP21
5、质谱分析
MALDI-TOF-MS鉴定
肽质量指纹谱技术(PMF)(含除盐)
其它难分析样品
MALDI-TOF-TOF
MALDI-TOF-TOF二级质谱:手动搜索1-3个肽段。
每增加1个肽段加300元
其它难分析样品
数据分析和检索
质谱图数据库检索,给出检索结果
6、特别打包方案
&&&&&&&公司提供2Dgel服务的各种打包方案(服务编号: BYP28),涵盖了从样品分析到电泳到质谱分析和数据处理分析的全过程。以一对样品为例,包括样品处理、预实验、双向电泳(6块胶)、差异分析、酶解切胶、100个的候选点PMF、10个候选点的TOF/TOF等,本公司将提供最优惠的价格以便您在节省科研费用和时间的同时获得最优质的服务。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
MALDI IMAGING 组织分子成像
&&&&&&&利用质谱仪直接检测组织切片,在一张切片上获得上千张蛋白组织分布图。本项技术可用于蛋白标志物发现、验证、组织多肽谱和疾病诊断,在同一块组织上实现病变区和非病变区之间的比较。
[服务内容]
肿瘤差异蛋白寻找
包括冷冻切片基质喷涂、质谱扫描、图形构建和差异蛋白分析
组织差异蛋白寻找
包括冷冻切片基质喷涂、质谱扫描、图形构建和差异蛋白分析切片量
BIOTYPER 蛋白指纹微生物分析鉴定
&&&&&&&传统的微生物分类包括表型分类、生理生化分类等分类方式,其归根结底都是微生物蛋白质差异的不同表现形式。而直接利用蛋白质进行微生物分类更能反映出不同微生物之间相互区别的本质,是最有效、最本质的微生物分类和鉴定方法。以高通量的MALDI-TOF为基础开发的微生物鉴定系统,可将由质谱检测得到的蛋白指纹应用于微生物鉴定。这项技术仅需要极少量的样品和处理费用,就可以在几分钟内鉴定出不明细菌、酵母菌和霉菌,能极好地替代经典的微生物鉴定和分类技术。
&&&&&&&本公司现有的微生物鉴定数据库中有超过175多个属,1300多个种的信息。涵盖了包括临床微生物、食品微生物、兽医微生物、性传播疾病微生物、环境微生物的细菌(包括放线菌)和真菌等各类微生物的超过2500条记录。能快速、高通量地完成数据库内微生物的鉴定,可准确鉴定到种或亚种的水平。
[服务内容]
微生物鉴定
包括样品处理、质谱检测、数据库搜索和解释
未知微生物鉴定
包括样品处理、质谱检测、数据库搜索和解释,微生物与数据库中其他微生物进化树
专业微生物蛋白指纹鉴定数据库构建
包括样品处理、质谱检测、20-30张质谱图获得,每个微生物获得标准谱、完整的数据库。
微生物分类学研究
包括样品处理、质谱检测、获得20-30张质谱图,每个微生物获得标准谱/微生物进化树
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
分子生物学解决方案
RNAi载体构建
&&&&&&&毅新兴业基于自身强大的技术实力,为广大的科研工作者提供个性化的shRNA表达载体构建服务,将科研工作者从烦琐的载体构建中解放出来。您只需按照自己课题的需要提供靶基因的Accession Number或基因序列,我们将对4个靶点进行shRNA序列设计,并最终构建让您满意的COMF-shRNA表达载体。
&&&&&&&构建shRNA表达载体,实现siRNA体内表达,是目前最先进的基因沉默方式。我公司构建的COMF-shRNA载体,具有如下特点:
siRNA表达长度可选,从常见的21bp到最新的29bp,都能满足客户的需求,其中29bp与其他长度相比,具有沉默效率更高、特异性更强的特点;
载体可选,从普通真核表达载体到逆转录表达载体,并能根据客户实验思路,携带不同的报告基因和抗性;
针对每个基因,选择4个位点构建COMF-shRNA载体,并保证其中至少有一个在mRNA水平上的沉默效率在70%以上;
提供2个阴性对照(空载体和无效GFP-shRNA载体);
提供10ug去内毒素的高纯度质粒,可直接用于转染,为客户节省宝贵的实验时间;
能根据客户需求,提供各类质检报告,包括PCR电泳图谱、测序结果等;
可提供后期相关服务,包括实时荧光定量PCR验证转染效率,病毒包装等,真正为客户提供整体解决方案。
&&&&&&&目前,我们已经成功为客户提供了近百个基因的COMF-shRNA试剂盒。其中针对GFP基因构建了4个载体,并通过在293T细胞共转染的方式进行了RNAi沉默效果的检测,结果显示,4个重组载体均达到很好的抑制效果,其中一个COMF-shRNA对GFP的抑制效率达到了90%(如下图)。
&&&&&&&分别将空载体和4个位点的COMF-shRNA与携带GFP基因的表达载体以1:1摩尔比共转染293T细胞,转染之后2天用荧光显微镜观察,其中COMF-shRNA1和COMF-shRNA2可以显著抑制GFP的表达。
高品质COMF-shRNA试剂盒
* COMF-shRNA完整型试剂盒增加了配套的高效转染试剂。本转染试剂是针对客户特异的COMF-shRNA挑选出来的,并经优化组合。
&&&&&&&我们对现有的技术平台进行整合,开发出一套适用于COMF-shRNA的一体化服务,从载体构建到RT-PCR验证、病毒包装等,为您最终得到理想的实验结果奠定坚实基础。
我们郑重承诺
&&&&&&&针对多个靶基因位点设计的shRNA表达载体,其中至少有一个在mRNA水平上的抑制效率不低于70%,否则将免费为客户重新设计并构建新的COMF-shRNA表达载体。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
&&&&&&&SNP是英文Single Nucleotide Polymorphism的缩写,中文翻译成“单核苷酸多态性”,即指在基因组水平上单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性,包括单碱基的转换、颠换和插入/缺失等。
&&&&&&&SNP是基因组DNA序列中最常见的变异形式,最大程度地代表了不同个体之间的遗传差异,被认为是应用前景最好的遗传标记物。对它的研究将帮助我们在疾病相关基因定位,认识人种、人群、个体间的遗传差异,研究基因组结构,研究疾病或耐药性与个体差异的关系,药物开发,临床诊断和辅助治疗,法医科学,农业资源开发,微生物株系鉴定等领域都有重要的应用。
下面我们列举了近年来SNP在一些生物领域的应用的文献,以供参考:
SNP与畜牧业:
Rohrer GA, Freking BA, Nonneman D. Single nucleotide polymorphisms for pig
identification and parentage exclusion. Anim
Genet. -8.
利用SNP对猪的品种与血统进行鉴定
Cheong HS, Yoon DH, Park BL, et al. A single
nucleotide polymorphism in CAPN1 associated with marbling score in Korean
cattle. BMC Genet. .
CAPN1基因上的一个SNP位点与韩国牛肉的品质相关
SNP与种植业:
Konishi S, Izawa T, Lin SY, et al. An SNP Caused
Loss of Seed Shattering During Rice Domestication. Science, 92-6
一个SNP位点与水稻驯化过程中落粒性丢失相关
SNP与医学:
Sun T, Gao Y, Tan W, et al. A six-nucleotide insertion-deletion polymorphism in the CASP8 promoter is
associated with susceptibility to multiple cancers. Nat Genet.?-60.
CASP8基因启动子中一个6bp的插入/缺失多态性与不同癌症的易感性有关
Scheurer ME, Amirian E, Cao Y, et al. Polymorphisms in the interleukin-4 receptor gene are associated
with better survival in patients with glioblastoma. Clin Cancer Res. 0-6.
白介素-4受体基因的多态性与恶性胶质瘤患者的存活率有关系
Tai AL, Mak W, Ng PK, et al. High-throughput
Loss-of-Heterozygosity Study of Chromosome 3p in Lung Cancer Using
Single-Nucleotide Polymorphism Markers. Cancer
用SNP标记高通量研究肺癌中3号染色体短臂的杂合度丢失
SNP与群体遗传学:
Mark JD, John DR, Stephen FS, et al. High-resolution haplotype structure in the human
genome. Nat Genet. -32.
人类基因组中的高分辨率单体型图结构
Xue Y, Zerjal T, Bao W, et al. Recent spread of a
Y-chromosomal lineage in northern China and Mongolia. AJHG. 2-6.
Y-染色体血统近期在中国北方及蒙古的扩展
SNP与药学:
Drysdale CM, McGraw DW, Stack CB, et al. Complex
promoter and coding region beta 2-adrenergic receptor haplotypes alter receptor
expression and predict in vivo responsiveness. PNAS, 83-8.
beta 2-肾上腺受体启动子及编码区复杂的单体型结构改变受体的表达并预测在体内的反应
&&&&&&&SNP的广泛应用,催生了大量检测技术。就实验手段来说,包括杂交、PCR、酶切、分子构象、测序等方法;就检测手段而言,包括凝胶电泳、荧光检测、芯片、质谱等方法。目前在国内市场上,常见的检测技术包括测序、DNA芯片、PCR-RFLP、TaqMan探针、SNPlex、质谱法等。
以下为几种检测方法的比较。
需自己做PCR。整体约需1~2月。
10-100万位点
后期大量数据分析,约需1~2月。
Illumina芯片
后期大量数据分析,约需1~2月。
引物需国外合成。到货期需4~8周。
引物需国外合成,到货期需4~8周。
从实验设计到数据分析,1个月内。
&&&&&&&毅新兴业公司以世界顶级的基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(Matrix-assisted laser desorption/ionization Time-of-flight
Mass Spectrometry,MALDI-TOF
MS)作为技术支撑平台,为您提供卓越的SNP研究整体解决方案。
&&&&&&&质谱是带电原子、分子或分子碎片按分子量(质荷比)的大小顺序排列的图谱。质谱仪可通过对物质的分子量(质荷比)进行检测,达到区分、鉴别物质的目的。SNP位点两个等位基因之间存在分子量差异,通过分型实验将差异放大,然后以质谱仪进行检测即可达到SNP分型的目的。
&&&&&&&图1:飞行时间质谱检测物质分子量的原理
&&&&&&&带电物质无电场的真空管(Drift region)中的飞行速度与分子量负相关,分子量越小,飞行速度越快,到达检测器(Detector)的时间越早,反之亦然。
&&&&&&&图2:飞行时间质谱法对SNP进行分型的原理
紧挨SNP位点设计一段探针,在反应体系中以ddNTP替代dNTP,使探针仅在SNP位点处延伸一个碱基即终止。根据SNP位点的不同,探针将结合不同的ddNTP,从而具有不同的分子量,质谱仪即可检测出这种分子量差异,从而实现SNP分型的目的。
&&&&&&&图3:实际检测效果图
质谱法能同时检测多个位点,此为对16个位点进行检测的峰图。
质谱法的优势
质谱仪直接检测分子的本质特征之一―分子量,不需要通过荧光标记来进行间接检测,准确性可靠;
灵敏度高,可检测低至10ng的核酸片段;
以384孔板的形式进行反应,每个反应孔内最高可检测18个位点,一方面满足了目前常见的中小规模的科研需要,另一方面,在提高通量的同时大大的降低了试剂损耗;
使用普通合成的引物,不带任何标记,也无需在国外定制,即加快了课题的进度,也降低了实验费用;
每个反应孔仅需10ul DNA(10ng/ul),特别适合于稀少样本;
以下为近年来利用质谱法检测SNP发表的部分文章:
COX, A., ET AL. (2007). &A common coding
variant in CASP8 is associated with breast cancer risk.& Nat Genet 39(3):
CASP8基因上一个常见的编码变异与乳腺癌风险有关
SLADEK, R., ET AL. (2007). &A genome-wide
association study identifies novel risk loci for type 2 diabetes.& Nature 445(7130): 881-5.
一项旨在发现并鉴定2型糖尿病的新的危险因素的全基因组关联研究
COSTAS, J., ET AL. (2005). &Relative
efficiency of the linkage disequilibrium mapping approach in detecting
candidate genes for schizophrenia in different European populations.& Genomics 86(3): 280-6.
连锁不平衡法检测精神分裂症候选基因在不同欧洲人群中相对效果
EDWARDS, A. O., ET
AL. (2005). &Complement factor H polymorphism
and age-related macular degeneration.& Science 308(5720):
备解素因子H的多态性及年龄相关的老年黄斑变性
JURINKE, C., ET AL. (2004). &MALDI-TOF
mass spectrometry: a versatile tool for highperformance DNA analysis.& Mol Biotechnol 26(2): 147-64.
MALDI-TOF质谱:一种通用的技术,可用于高性能的DNA分析
血样采集避免使用肝素作为抗凝剂,DNA提取避免使用EDTA进行洗脱,肝素和EDTA对PCR都有抑制作用;
血样和DNA样品-20度保存,避免反复冻融;
DNA浓度&10ng/ul,体积&10ul,纯度OD260/OD280在17-1.9之间;
电泳检测DNA样品,确保片段长度在10kb以上;
样品请以96孔板的形式提供,为了防止交叉污染,请确保封膜严实,并平稳放置;
样品寄送时确保放置足够量的干冰,在运输过程中避免颠覆,寄送样品前需与我公司确认,以便我们安排接收;
对于需要分型的位点,您仅需提供突变位点及其前后各100bp的序列,突变位点以方括号表示,如[G/A];若在序列中存在其他突变位点,请以N表示,整个文档以Excel表格式提供。
AGCGCT……GAG[G/A]GGGTC……TCNATATTG
ACATCA……AGG[C/T]GGGCC……GTGGTGGTT
图4:引物设计界面
图5:整体效果图
此为对384份DNA检测18位点的效果图,深绿色表示18个位点全部检测出来,红色表示18个位点全部没有检测出来,浅绿色和黄色介于两种情况之间。
图6:数据分析
通过连锁不平衡分析,筛选合适的标签SNP(htSNP),为客户节省大量的费用。
&&&&&&&客户首先确定了几个目标基因,然后制作DNA池(DNA pool),通过混合样本对目标基因进行测序,确定了20多个SNP位点;我们针对这些位点进行了引物设计。
&&&&&&&最终数据分析结果如下(结果报告中另还提供引物序列、测序结果、样本检测电泳图、整体效果Excel表格等):
污染情况分析:空白样本全部没有数据,说明不存在DNA污染情况
检出率(call rate):在6144个数据中,有分型结果的为6071个,检出率为98.8%;
具体到每个样本,有3个样本的call rate
& 80%,其余样本的call rate均大于80%,其中344个样本的call rate为100%;
具体到每个位点,所有位点的call rate均大于95%,其中11个位点的call rate大于99%
获得各位点群体频率
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
&&&&&&&毅新兴业为客户提供从实验设计、实验操作、质量报告到后期回访跟踪等一整套病毒包装服务。我们的病毒包装系统包括腺病毒(AdV)、腺相关病毒(AAV)和慢病毒(LVs)表达系统。我们将根据客户的要求及课题需要,为客户量身定做实验方案,以满足不同的需求。
&&&&&&&三类病毒系统对比
腺病毒载体构建及包装服务
&&&&&&&腺病毒(Adenovirus,AdV)由于其宿主范围广、转染效率高、表达强度强的显著优点成为目前运用最普遍的病毒载体之一。本公司在Adeasy、AdMax等腺病毒系统的基础上,经过不断的改进与优化,积累了丰富的经验,建立了一套成熟的腺病毒包装系统。本系统是以复制缺陷型腺病毒DNA为骨架构建成的重组腺病毒系统,在穿梭载体、病毒骨架载体及包装细胞系等方面有很大优势,出毒快捷、滴度高、包装可靠!
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
高品质的腺病毒载体构建系统
载体构建周期短,重组腺病毒载体克隆阳性率高,高达95%以上;
完整的穿梭载体系统(部分载体如下表),能够满足各种实验要求;
包装成功率达到100%,主要基于对包装细胞系的改造及基因在包装细胞系的受控表达,其他腺病毒包装系统远远达不到这样的包装成功率;
病毒滴度高,纯化后可以达到3×1011 - 5×1011 pfu/ml,体积在2ml左右。
部分穿梭质粒列表
慢病毒载体构建及包装服务
&&&&&&&慢病毒载体(Lentiviral vector, LVs)是在HIV-1病毒基础上改造而成的病毒载体系统,它能高效将目的基因(或RNAi)导入动物和人的原代细胞或细胞系。与腺病毒不同的是,慢病毒能将目的基因整合到宿主细胞基因组中,并随细胞基因组的分裂而分裂;并且,慢病毒载体不表达任何HIV-1蛋白,免疫原性低,在注射部位无细胞免疫反应,体液免疫反应也较低,不影响病毒载体的第2次注射;另外,慢病毒载体能有效感染并整合到非分裂细胞中。
&&&&&&&本公司生产的慢病毒载体属于“第三代”慢病毒载体,其基因组的3’ LTR的增强子功能发生了缺失,从而形成了所谓的“自灭活”(Self-inactivation,SIN),即该病毒基因组整合到细胞基因组后,不会产生新的子代病毒,也降低了对周围基因的意外激活,因此具有较好的安全性。病毒的包膜上嵌合了来自水泡口炎病毒(Vesicular Stomatitis Virus)的VSV-G蛋白,使病毒能感染更多种细胞(包括分裂和非分裂细胞),且病毒更趋稳定。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
实时定量荧光PCR
&&&&&&&实时定量荧光PCR因其无需电泳,快速方便,能对未知模板进行定量而广受青睐。本公司承接各类实时定量荧光PCR检测服务(服务编号:BYGT01),包括SNP分型、绝对定量、mRNA表达定量、DNA芯片数据验证、siRNA筛选等。所用技术为SYBR Green染料法和TaqMan探针法。
绝对定量:通过标准曲线,检测目的DNA的拷贝数,主要应用于病毒拷贝数的精确定量等;
mRNA表达定量:检测mRNA表达量相对于house keeping基因的变化,主要用于检测不同处理水平或不同来源的组织对基因表达的影响;
DNA芯片数据验证:基因表达芯片中约有1/3的结果为假阳性,使用实时荧光定量PCR技术进行验证,能为您的结果去伪存真;
siRNA筛选:siRNA导入体内后,使用实时定量荧光PCR技术能在第一时间获得siRNA对目标基因的抑制效果。
&&&&&&&将客户提供的PCR产物或指定的目标区域,克隆至载体中,为客户提供3个阳性克隆,以及相应的检测结果(PCR电泳图谱,测序结果等)(服务编号:BYGC01)。
&&&&&&&本公司可提供各种载体,携带不同报告基因(GFP、RFP、Luciferase等),携带不同标签(HA、myc、His、Flag等)的原核细胞、真核表达载体及腺病毒、逆转录病毒载体,可满足不同的转基因实验要求。
&&&&&&&客户可以选择不同载体,也可以提出不同的实验要求,如定点突变(服务编号:BYGC02),加酶切位点(服务编号:BYGC03)等。
&&&&&&&本公司还提供引物设计与合成(服务编号:BYGT02),DNA/RNA样品提取(服务编号:BYGT03)等服务。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
生物信息学分析解决方案
&&&&&&&面对海量的质谱和芯片数据,如何才能够取其精华,去其糟粕???
&&&&&&&答案只有一个,那就是-高效,快速,准确的生物信息分析!
&&&&&&&我们为客户提供蛋白质组学,基因组学,代谢组学等各个领域的专业生物信息分析平台和解决方案。
[服务内容]
质谱数据分析(服务编号:BYB01):在标准流程分析的结果之上,采用我们自主研发的数据分析软件和优化的生物数学算法(包括支持向量机、主成分分析、决策树等),进行深层次的数据挖掘分析,以满足客户的不同层次的需求。
芯片数据分析(服务编号:BYB02):通过对芯片数据的归一化分析、直观视图分析、统计学分析和生物学分析后,测定细胞生长不同时期的基因表达、测定正常组织与肿瘤组织的DNA变化,测定用药前后DNA发生的变化、测定基因突变等;并针对不同的研究目的,进行差异基因表达分析、聚类分析和判别分析;
454测序分析(服务编号:BYB03):国内第一台454测序仪,可以对细菌、真菌、真核生物进行快速高通量的测序服务。由经验丰富的454数据分析人员运用专业的整合软件进行序列的整合,速度比传统方法提高数倍。
[应用实例]
&&&&&&&某疾病诊断模型建立和外部验证
&&&&&&&采用60例样本利用神经网络算法进行诊断预测模型的建立(30例疾病;30例对照);
表一 差异蛋白列表 (红标记的为SNN选用的差异蛋白峰)
对于这些差异蛋白,我们选择了两个作为例子来检测其分组能力(图一)。从此图可以看出,疾病组和对照组没有交叉区域,分组明显,说明所选择的蛋白分组能力显著。
图一 两个差异蛋白1856Da(X-轴)和1778Da(Y-轴)样品分布
(红色:对照样品;绿色:疾病样本)
用选定的5个特征峰(表一中红色标记峰),利用经过优化的神经网络模型建立模型(图二);模型识别率为100%,预测能力为95%。
图二 利用Clinprotools建立SNN模型
在建立完模型之后,应用73例样品(其中对照36例,
疾病37例)对其进行外部验证,验证结果见表二。模型的总准确率达到98.6%,说明此模型足以区分正常样本和疾病样本。
模型判断为对照
模型判断为疾病
对照(36)
疾病(37)
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
SCI论文及课题申请服务
&&&&&&&为了更好地展示广大生命科学工作者的实验成果,毅新兴业为客户提供SCI论文编辑及课题申请服务,真正实现从课题创意至文章投递的整套科研服务流程。
SCI论文编辑
根据客户提供的中文或英文论文,进行论文的翻译、编辑、润色及投递服务。
课题申请服务
联合我们的技术平台与客户的科研资源合作进行课题的申请:提供建议、修改及撰写服务。
课题设计申请、试验指导、论文写作发表“一条龙”服务
基于我们的专家力量和技术平台为客户量身定做课题设计,并进行试验指导服务,以及论文写作发表服务
我们的优势
专业的合作群体:包括生物、医药各个领域的专家,为您提供专业的修改意见;
拥有多名资深母语为英语的期刊编辑顾问资源;
公司多年的专业技术服务背景可设身处地为您的文章撰写提供实验设计建议;
具有多年技术工作的职业敏感,提供严密的知识产权保护工作,让您无后顾之忧。
BYLit01 SCI论文编辑: 论文评估(我们的专家团队将从内容质量和语言表达等角度对您的文章提供评估,给出中肯的修改的意见与建议,并对文章是否具有发表在SCI收录杂志上的可能性给出专业性评估。)
&&&&&&&&&&&&&&↓
&&&&&&&根据评估结果选择我们的服务种类(专业中译英、专业英语修改、母语化润色和SCI文章代投稿),并签订服务合同和保密协议
&&&&&&&&&&&&&&↓
&&&&&&&按照合同内容对您的论文进行编辑(如果您选择了我们的多项服务,在每一项服务完成之后您都会收到我们的编辑结果,在您确认对该项服务质量满意后我们开始下一项服务内容),文章投稿
&&&&&&&&&&&&&&↓
&&&&&&&您的文章被接受了!
BYLit03课题申请服务:我们公司的专家与您交流课题设计思路
&&&&&&&&&&&&&&↓
&&&&&&&我们设计2-3个课题思路,做出简要的试验方案供您选择
&&&&&&&&&&&&&&↓
&&&&&&&在您确定实验方案后双方签订委托服务合同,确认收到预付款后我们开始课题的撰写工作
&&&&&&&&&&&&&&↓
&&&&&&&就课题申请书进行双方意见的交流,多次修改直到您对申请书的质量满意为止
&&&&&&&&&&&&&&↓
&&&&&&&提交课题申请书终稿
BYLit03课题设计申请、试验指导、论文写作发表“一条龙”服务:基于我们的专家力量和技术平台为客户量身定做课题设计,并进行试验指导服务,以及论文写作发表“一条龙”服务。欢迎洽谈合作。
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
更多实验技术服务,请和我们联系。我们衷心希望成为您实验的伙伴。
真诚为您的实验保驾护航!
contact us for more experimental services. We earnestly hope to be your
partners, and escort your experiments sincerity!
毅新兴业(北京)科技有限公司是一家新兴的高科技公司,初成立于2005年10月,后在公司发展以及引入新的战略投资伙伴的基础上,于2008年1月重组。公司具有完善的国际化企业架构,由海外留学归国博士领军,技术团队包括多名资深生物学和生物医学专家以及临床医生,并由多名经验丰富的质谱、液相、双向电泳、分子生物学以及生物信息学分析专家组成。
&&&&&&&我们的使命是应用生命科学技术服务于人类的健康事业。公司建立了蛋白质组学、分子生物学与生物信息学科研平台,为客户量身定做各种解决方案,提供从实验设计、实验检测到生物统计与数据分析等一整套全方位技术服务。
&&&&&&&我们的宗旨是为客户提供最好的服务。在生命科学及临床医学领域,公司拥有包括美国哈佛大学女子医院、哈佛大学烧伤医院、麻省总医院、美国斯隆-凯瑟琳癌症研究中心、军事医学科学院国家生物医学分析仪器中心、中国医科大学附属第一医院、中国人民解放军301医院、首都医科大学附属佑安医院、湖南湘雅医学院、北京大学生命科学院、北京大学医学部等在内的众多国内外知名客户。
&&&&&&&毅新兴业一心为人类的健康事业作出贡献,为客户提供生命科学研究的怡心服务,您对我们的信任是我们不断前进的动力!
&&&&&&&毅新兴业 怡心服务!
毅新兴业(北京)科技有限公司
BIOYONG TECHNOLOGIES
北京市海淀区苏州街18号长远天地大厦A2座1209室
No.1209 Longrange Bldg, Haidian District Beijing, 100080, China
电话:010-82
传真:010-
谨慎科研 快乐生活!
由BIOYONG委托 生物通 设计制作}

我要回帖

更多关于 dna纯度测定 的文章

更多推荐

版权声明:文章内容来源于网络,版权归原作者所有,如有侵权请点击这里与我们联系,我们将及时删除。

点击添加站长微信