与限制酶有关的例题及解析_陈品琴_百度文库
两大类热门资源免费畅读
续费一年阅读会员，立省24元！
评价文档：
与限制酶有关的例题及解析_陈品琴
阅读已结束，如果下载本文需要使用
想免费下载本文？
你可能喜欢下表中列出了几种限制酶识别序列及其切割位点。下图是转基因抗病香蕉的培育过程，含目的基因的DNA和质粒_百度知道
提问者采纳
(1)SmaⅠ会破坏质粒的抗性基因和外源DNA中的目的基因 (2) BamHI和HindⅢ&&& &外源DNA&&&&& 目的基因&&&& &质粒(3)①④⑤(4)全能性&&& &脱分化&&& &再分化(5)生长素&&& & 细胞分裂素(6)用虫子感染转基因香蕉，观察其是否抗虫
其他类似问题
为您推荐：
识别序列的相关知识
等待您来回答
下载知道APP
随时随地咨询
出门在外也不愁50VIRS：基于DNA序列的限制性酶切位点识别的可视化工具-第3页
上亿文档资料，等你来发现
50VIRS：基于DNA序列的限制性酶切位点识别的可视化工具-3
新ｊ７产学硕士学位论文限制性内切酶的应用和分类５；?粘性末端；在识别序列的两个对称点切开ＤＮＡ双链，产生带单链；３５．＇．－Ｇｃ盔哪，Ａ＇Ｉ－ＦＣ－５ｔ３＇丽３；３＇－Ｃ弘ＣＧＴＣ－５’带３＇－Ｇ’ＡＣＧＴＣ．；?Ｇ．３平末端；切割点是识别序列的对称轴，产生平端或平端（ｂｌｕ；耋Ｉ－忠：３：竺３５１ｗ－ＴＡ＋枞Ｔ－３５’＇５；１．１．５限制性内切酶的命名原则
新ｊ７产学硕士学位论文限制性内切酶的应用和分类５７侧切割底物，ＤＮＡ双链交错断开产生５７突出粘性末端；若在３７侧切割，则产生３７突出粘性末端；在回文对称轴上同时切割ＤＮＡ的两条链，则产生平末端。’产生平末端的ＤＮＡ可任意连接，但连接效率较粘性末端低，以下是这２个末端产生的过程。?粘性末端在识别序列的两个对称点切开ＤＮＡ双链，产生带单链尾的粘性末端，如ＥｃｏＲＩ切割后产生５７粘性末端，ＰｓｔＩ切割后产生３７粘性末端：３５．＇．－Ｇｃ盔哪，Ａ＇Ｉ－ＦＣ－５ｔ３＇丽３５．＇．ｃ丌－ＧＡＡ＋Ｍ飞：；３＇－Ｃ弘ＣＧＴＣ－５’带３＇－Ｇ’ＡＣＧＴＣ．５５’．ＣＴＧＣ武Ｇ?３。５’ＣＴＧＣＡ．?Ｇ．３平末端切割点是识别序列的对称轴，产生平端或平端（ｂｌｕｎｔｅｎｄ）。特点：４－８个ｂｐ，具有回文结构的ＤＮＡ片段。如：ＡｈａｌＩＩ和ＤｒａＩ的识别和切割序列都产生平末端：耋Ｉ－忠：３：竺３５１ｗ－ＴＡ＋枞Ｔ－３５’＇５１．１．５限制性内切酶的命名原则与术语１．１．５．１命名原则３’．ＡＡ芦汀ＴＴ．‘ＤｒａＩ３’?～Ｖ、限制性核酸内切酶的命名，一般是以微生物属名的第一个字母和种名的前两个字母组成，第四个字母表示菌株（品系）。例如，从ＢａｃｉｌｌｕｓａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓＨ中提取的限制性内切酶称为ＢａｍＨ，在同一品系细菌中得到的识别不同碱基顺序的几种不同特异性的酶，可以编成不同的号，如ＨｉｎｄｌＩ、ＨｉｎｄｌＩＩ，ＨｐａＩ、ＨｐａｌＩ，ＭｂｏＩ、ＭｂｏＩ等。１．１．５．２专业术语在后续的文章中可能会涉及酶的命名外，还会有些酶的专业术语，所以下面列出了一些限制性酶的术语：?同裂酶（ｉｓｏｓｃｈｉｚｏｍｅｒ）有一些来源不同的限制酶识别的是同样的核苷酸靶子序列，它产生同样的切割，形成同样的末端。虽然来源于不同物种，但能识别相同ＤＮＡ序列的限制性内切酶，切割位点可以相同也可以不同。不过国内和国外在同裂酶的定义及其定名上，随不同的人有许多差浙江大学硕士学位论文目前存在的问题异。国内外还有另一种定义，称同裂酶是来源于不同物种但能识别相同ＤＮＡ序列且切割方式相同的酶。这两种定义出现的比例均较大，均具有一定的代表性。?异功酶（ｎｅｏｓｃｈｉｚｏｍｅｒ）它是指具有和原型酶有相同的识别序列，但剪切位置不同的酶。正是由于有这样的特性，使其在一些特殊的实验中得到广泛的应用。?同尾酶（ｉｓｏｃａｕｄａｍｅｒ）这一类的限制酶来源各异，识别的靶字序列也不相同，但产生相同的粘性末端。由同尾酶产生的ＤＮＡ片段，是能够通过其粘性末端之间的互补作用彼此连接起来的。当把同尾酶切割的ＤＮＡ片断与原来的限制性内切酶切割的ＤＮＡ片段连接后，原来的酶切位点将不存在，不能被原来的限制性内切酶所识别。?同工酶（ｉｓｏｚｙｍｅ，ｉｓｏｅｎｚｙｍｅ）是指生物体内催化相同反应而分子结构不同的酶，它的基因先转录成同工酶的信使核糖核酸（ｍＲＮＡ）、后者再转译产生组成同工酶的肽链，不同的肽链可以不聚合的单体形式存在，也可聚合成纯聚体或杂交体，从而形成同一种酶的不同结构形式。１．２目前存在的问题限制性酶毫无疑问是目前分子生物学中最基本的工具之一。过去的４０多年来，已经有３９００多种的限制性酶从不同的细菌中分离出，同时在市场中可供选择的酶也是越来越多样化，面对琳琅满目的商品，这也给研究人员在酶的选择上带来了一定的困难。通常研究人员会使用那些具有很多识别位点的常用酶，而避免使用一些特异性的酶。因为特异性的酶要花大量的时间熟悉它的属性以及寻找提供的厂商。而且研究人员一般不会注意到除了常用酶外，还有异型酶也可以对目标序列进行识别和剪切。实际上，大约有３３０个不同的ＤＮＡｍｏｔｉｆ可以被限制性酶所识别，但每一个ＤＮＡｍｏｔｉｆ都只有一个原型酶。除了这些原型酶以外，平均大约还有１０个左右其它的限制性酶也能识别原型酶所识别的序列，这些酶被使用的概率往往不大，通常被人们所忽略。当一个位点要被插入一个不兼容的片段时，常常需要这些特异性的酶来解决问题。例如，ＡｐａＩ是一个经常用到的限制性酶，它的剪切位置是［ＧＧＧＣＣＩＣ］，但ＡｐａＩ这个酶它产生的片段只能自身相互匹配。然而，如果用Ｂｓｐｌ２０Ｉ或ＢｓｐＯＭＩ（都是商业酶，剪切的位置是［ＧＩＧＧＣＣＣ】）代替ＡｐａＩ的话，获得的片段就可以和ＮｏｔＩ【ＧＣＩＧＧＣＣＧＣ］所产生的片段相联接，而不需要再做相关的分子修补。沙；ｊ大学硕士学位论文现有的解决方案像类似的情况还有很多，其它常用的酶基本上都有相对应的异功酶，如Ｋｐｎ／和Ａｓｐ７１８Ｉ，ＳｍａＩ和Ｃｆｒ９Ｉ等。对于如此多酶的选择，研究人员很难快速的判定实验应该需要的是什么样的酶，而他们往往只会选择他们所熟悉的酶，这可能会给实验带来很多不便，也可能造成资源的浪费。除此之外，他们还需要花大量的时间在网上搜索这些酶的商业来源。１．３现有的解决方案为了解决以上存在的问题，目前几个基于Ｗｅｂ服务的数据库和本地软件都已经实现了自动对酶切位点的预测和酶详细信息的查询，它们可以对用户提交的ＤＮＡ序列进行分析，给出可供使用的酶作为参考，但这些软件参差不齐，各有优缺点。１．３．１ＮＥＢｃｕｔｔｅｒ２．０ＮＥＢＣｕｔｔｅｒ２．０（Ｖｉｎｃｚｅ．Ｔ．ｅｔａＬ．２００３）是著名的新英格兰生物公司开发的一款在线的限制性酶切位点的分析软件，它主要针对用户提交的单个ＤＮＡ序列，给出一个酶切的可视化限制图谱，域澍还提供了参－９切割的酶的ＲＥＢＡＳＥ（Ｒｏｂｅｒｔｓ，Ｒ．Ｊ．ｅｌａＬ，１９９９）的信息以及所有可能被甲基化的信息，数据和ＲＥＢＡＳＥ的数据库同步更新。ＮＥＢＣｕｔｔｅｒ２．０由多个程序模块组成，这些模块执行的算法是用Ｃ语言编写，而前台的可视化部分是用ＰＨＰ编写，执行动态的网页呈现效果。后台程序运行在单处理器、４４０ＭＨｚ的ＳｕｎＮｔｅｒａＴｌ服务器上，系统为ＳｕｎＯＳ５．９，数据库为ＳＱＬ，网络服务由Ａｐａｃｈｅ提供。算法上，它还提供了开发阅读框（ＯＲＦ）的预测，预测在细菌的编码序列上，从启动子到终止子之间的最长ＤＮＡ片段。它的准确率和用户输入序列的长度有关，随着长度的变短而降低。但ＮＥＢｃｕｔｔｅｒ２．０在用户的交互上做的还是不够理想，它不能同时提交多个序列，一次只能对一条序列进行处理分析，这大大的降低了研究人员工作效率，他们需要一条一条的往上进行粘帖。ＮＥＢｃｕｔｔｅｒ２．０由于是一款商业化的软件，所以它的数据库中只提供了ＮＥＢ公司所销售的酶的信息，而屏蔽了其它公司的产品信息。这对研究人员在酶的选择上带来了一定的局限性。并且ＮＥＢｃｕｔｔｅｒ２．０它只提供了酶的剪切位点的预测功能，对于更加深入的分析研究还显得略有不足。浙江大学硕士学位论文现有的解决方案１．３．２ＲＥＭＡＲＥＭＡ（Ｓｚｕｂｅｒｔ。Ｊ．ｅｆａ１．，２００７）也是提供限制性酶在ＤＮＡ序列中剪切位点的一个网络平台，它的优点是能同时分析多条ＤＮＡ序列，提供给用户预测的片段的长度和位点，同时也提供酶的限制性图谱。用户可以对参与反应的酶进行选择，根据酶的分类，例如原型酶，剪切后产生的３７末端、５７末端或最长的识别序列等，自定义哪些酶是否参与剪切作用。除此之外，ＲＥＭＡ还能对多个序列剪切同一条ＤＮＡ所产生的片段是否会重新链接在一起进行判断，给出酶的合适搭配。在用户提交多个序列的ＤＮＡ后，能对序列的形状进行定义，是线形的还是圆形的质粒。接着它会对提交的序列的正反链进行分析，并产生一个打分矩阵数据表作为报告结果，如果多条序列同时进行剪切时，会给出不同酶的打分值，这样用户就可以进行优化选择。虽然ＲＥＭＡ能满足用户的各方面需求，但由于结果呈现的过于简单，它以数据和表格的形式反馈给用户，反映的信息不如可视化图形结果来的直接。并且只提供简单的分析，对后续的分析显的不足。在另一方面，它也并不提供酶的相关信息供用户查询，所以用户还得单独去查这些酶的信息，造成了资源和时间上的浪费。在更新方面，ＲＥＭＡ现在已经停止了，随着越来越多酶的被发现，ＲＥＭＡ的酶库对科研人员来说已经明显的不足。Ｃｌｅａｖｅｒ（Ｊａｒｍａｎ．ＳＮ．ｅｌａ１．，２００６）是一款本地的限制性酶切位点预测软件，它主要针对某些物种中的序列具有偏好性的剪切，能从同源物种的ＤＮＡ序列中通过剪切的片段分析识别出它们的不同特性。它是一款遵循ＧＮＵ通用公共许可协议的开源软件，任何人可以对其使用和修改。该程序是用Ｐｙｔｈｏｎ语言写的，能在Ｌｉｎｕｘ、Ｗｉｎｄｏｗｓ和ＭａｃＯＳＸ等多系统下运行。它的优点正如前面所说的能在同源的ＤＮＡ序列中找出共同作用的特异性的酶。其中的数据库信息以ＸＭＬ的格式贮存，来源于ＧｅｎＢａｎｋ、ＤＤＢＪ和ＥＭＢＬ这三个数据库，除了包含不同物种的同源ＤＮＡ序列之外，还囊括了其它的一些诠释资料。用户可以根据数据库提供的信息把提交的序列进行归类，在物种、属、家族或更高的层次进行划分。Ｃｌｅａｖｅｒ接收的序列格式有ＦＡＳＴＡ，ｃｌｕｓｔａｌ，ＭＥＧＡ和ＩＮＳＤＳｅｑＸＭＬ等格式。此款软件的缺点主要体现在，所涉及到的物种范围比较狭窄，应用不具有广泛性。还有就是同ＲＥＭＡ软件一样，结果也是以文本形式提供，没有可视化界面，提供酶的信息也不够全面，更没有进一步分析的功能。．＇．浙江大掌硕士学位论文研究思路１．３．４ＲｅｔｏｏｌｓＲｅｔｏｏｌｓ（Ｍａｒｔｉｎ，Ｐ．ｅｌａｌ．２００６）是一款实验室限制性酶的管理软件，它具有很强的兼容性，而且易操作。在它的数据库中收集了现在所有已发现的酶的详细信息，其中包括基本信息、反应所需的温度、缓冲液和反应时间等等。数据库中列有４个表，第一个表格ＡｌｌＲＥｎａｒ包含的是所有已知的酶的基本信息，第二个表格Ｐｒｏｔｏｓ包含的是各种原型酶的同裂酶和异功酶的信息。第三个表格由“ＢＲＬＢｕｆｆｅｒｓ”，“ＭＢＩＢｕｆｆｅｒｓ”和‘＇ＮＥＢＢｕｆｆｅｒｓ”组成，分别对应不同商业公司所提供的缓冲液。第四个表格是由用户根据实验室里已有的酶进行重新分组，从而统一、规范管理。Ｒｅｔｏｏｌｓ是目前所有软件中信息最全面的一款软件，而且它能根据每个实验室的不同，进行个性化的定制。Ｒｅｔｏｏｌｓ在一定程度上起到了提高研究人员的工作效率，然而它只起到一个数据库的存贮作用，更偏向查询与管理功能，并不具备对限制性酶在ＤＮＡ上的剪切位点预测功能，也不提供限制性图谱。所以它的应用比较狭窄，而且使用此款软件还需要向开发者索取Ｌｉｃｅｎｃｅ，才能开通管理员的权限。１．４研究思路１．４．１设计目标网络中已经有狠多’的软件可以起到对限制性酶剪切位点的预测作用，上面所介绍的４种只是使用范围较广泛、功能较强大的著名软件，虽然这些软件各有其优点，但我们还是可以看到它们的很多不足之处。这些不足之处在于酶数据库信息的不全面性。结果或以数据的形式呈现给用户，没有达到可视化的效果，用户不能很直观的从结果中得到有用的信息。另外，其中的一些软件一次只能对一条ＤＮＡ序列进行处理，这种处理方式大大的降低了用户的使用效率。除此之外，还或多或少都在数据更新方面存在着一定的缺陷，这些缺点给分子生物学实验者带来了极大的不便。为了克服这些困难，我们开发了限制性酶切位点识别的可视化工具ＶＩＲＳ，该工具作为一款在线软件，具有人性化的界面、高性能的算法、并且定期更新，十分适合分子生物学实验者的使用。它除了实现ＤＮＡ序列的酶切位点的预测的基本功能外，还包括了：（１）实现了可视化的预测，结果以综合性图形报告呈现给用户。（２）能同时对多个ＤＮＡ序列进行处理，提高用户的使用效率。．Ｒ．包含各类专业文献、专业论文、幼儿教育、小学教育、应用写作文书、各类资格考试、中学教育、行业资料、高等教育、50VIRS：基于DNA序列的限制性酶切位点识别的可视化工具等内容。　下表为常用的限制性核酸内切酶（限制酶）及其识别序列和切割位点，由此推断的以下说法（　　）限制酶名称_百度知道
下表为常用的限制性核酸内切酶（限制酶）及其识别序列和切割位点，由此推断的以下说法（　　）限制酶名称
下表为常用的限制性核酸内切酶（限制酶）及其识别序列和切割位点，由此推断的以下说法（　　）限制酶名称&识别序列和切割位点&限制酶名称&识别序列和切割位点BamHⅠG↓GATCCKpnⅠGGTAC↓CEcoRⅠC↓AATTCSau3AⅠ↓GATCHindⅡGTY↓RACSmaⅠCCC↓GGG（注：Y=C或T，R=A或G）A．限制酶切割后不一定形成黏性末端B．限制酶的切割位点一定在识别序列的内部C．不同限制酶切割后一定形成不同的黏性末端D．一种限制酶一定只能识别一种核苷酸序列
提问者采纳
A、SmaⅠ切割位点为CCC↓GGG，形成的是平末端，A正确；B、Sau3AⅠ的切割位点位于识别序列的一侧，B错误；C、BamHⅠ和Sau3AⅠ切割后形成的相同的黏性末端，C错误；D、因为Y=C或T，R=A或G，所以HindⅡ限制酶可识别多种序列，D错误．故选：A．
其他类似问题
为您推荐：
限制性核酸内切酶的相关知识
等待您来回答
下载知道APP
随时随地咨询
出门在外也不愁（7分）（1）0，2　（2）高　SmaⅠ会破坏质粒的抗性基因，外源DNA中的目的基因　（3）质粒和合目的基因的外源DNA片段自身环化（4）DNA连接　鉴定和筛选合目的基因的细胞　（5）蔗糖为唯一含碳营养物质
请选择年级高一高二高三请输入相应的习题集名称(选填)：
科目：高中生物
来源：学年河南省许昌市四校高二下学期第一次联考生物试卷
题型：综合题
下表中列出几种限制酶识别序列及其切割位点，图1、图2中箭头表示相关限制酶的酶切位点，请回答下列问题限制酶BamHⅠHind ⅢEcoRⅠSmaⅠ识别序列及切割位点G↓GATC CC CTAG↑GA↓AGCT
TT TCGA↑AG↓AATT
CC TTAA↑GCCC↓GGGGGG↑CCC(1)一个图Ⅰ所示的质粒分子经SmaⅠ切割后，含有&&&&&&&&个游离的磷酸基因(2)若对图中质粒进行改造，插入的SmaⅠ酶切位点越多，质粒的热稳定性越&&&&&&&&&&&&&&&(3)用图中的质粒和外源DNA构建重组质粒，不能使用Sma Ⅰ切割，原因是&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&.(4)与只使用EcoRⅠ相比较，使用BmaHⅠ和Hind Ⅲ两种限制酶同时处理质粒、外源DNA的优点在于可以防止&&&&&&&&&&&&&。(5)为了获取重组质粒，将切割后的质粒与目的基因片段混合，并加入&&&&&&&&&&&&&&&酶(6)重组质粒中抗生素抗性基因的作用是为了&&&&&&&&&&&&&&&。(7)为了从cDNA文库中分离获取蔗糖转运蛋白基因，将重组质粒导入丧失吸收蔗糖能力的大肠杆菌突变体，然后在&&&&&&&&&的培养基中培养，以完成目的基因表达的初步检测
科目：高中生物
来源：学年甘肃兰州一中高三上期期末考试生物卷（解析版）
题型：综合题
（15分）下表中列出了几种限制酶识别序列及其切割位点，图1、图2中箭头表示相关限制酶的酶切位点。请回答下列问题：
(1)一个图1所示的质粒分子经Sma Ⅰ切割前后，分别含有____ 、____个游离的磷酸基团。
(2)若对图中质粒进行改造，插入的Sma Ⅰ酶切位点越多，质粒的热稳定性越______。
(3)要用图1中的质粒和图2中外源DNA构建重组质粒，不能使用Sma Ⅰ切割,原因是&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&
。
(4)与只使用EcoR Ⅰ相比较，使BamH Ⅰ和Hind Ⅲ两种限制酶同时处理质粒、外源DNA的优点在于可以防止___________________________&&&&&&&&&&&&
__。
(5)为了获取重组质粒，将切割后的质粒与目的基因片段混合，并加入________酶。
(6)重组质粒中抗生素抗性基因的作用是为了_________________________________。
(7)为了从cDNA文库中分离获取蔗糖转运蛋白基因，将重组质粒导入丧失吸收蔗糖能力的大肠杆菌突变体，然后在____________的培养基中培养，以完成目的基因表达的初步检测。
科目：高中生物
来源：2013届黑龙江龙东高二下学期高中教学联合体期末生物试卷（解析版）
题型：综合题
下表中列出几种限制酶识别序列及其切割位点，图1、图2中箭头表示相关限制酶的酶切位点。请回答下列问题。
（1）一个图1所示的质粒分子经SmaⅠ切割前后，分别含有　　　　个游离的磷酸基团。
（2）若对图中质粒进行改造，插入SmaⅠ酶切位点越多，质粒的热稳定性越　　　。用图中的质粒和外源DNA构建重组质粒，不能使用SmaⅠ，原因是　　　　　　　　　　。
（3）与使用EcoRⅠ相比较，使用BamHⅠ和HindⅢ两种限制酶同时处理质粒、外源DNA的优点在于可以防止　　　　　　　。
（4）为了获取重组质粒，将切割后的质粒与目的基因片段混合，并加入　　　酶。重组质粒中抗生素抗性基因的作用是为了　　　　　　　。
（5）为了从cDNA文库中分离获取蔗糖转运蛋白基因，将重组质粒导入丧失吸收蔗糖能力的大肠杆菌突变体，然后在　　　　　　　　　的培养基中培养，以完成目的基因表达的初步检测。
科目：高中生物
来源：2012届河南省许昌市四校高二下学期第一次联考生物试卷
题型：综合题
下表中列出几种限制酶识别序列及其切割位点，图1、图2中箭头表示相关限制酶的酶切位点，请回答下列问题
识别序列及
(1)一个图Ⅰ所示的质粒分子经SmaⅠ切割后，含有&&&&&&&&
个游离的磷酸基因
(2)若对图中质粒进行改造，插入的SmaⅠ酶切位点越多，质粒的热稳定性越&&&&&&&&&&&&&&&
(3)用图中的质粒和外源DNA构建重组质粒，不能使用Sma Ⅰ切割，原因是&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&
.
(4)与只使用EcoRⅠ相比较，使用BmaHⅠ和Hind Ⅲ两种限制酶同时处理质粒、外源DNA的优点在于可以防止&&&&& &&&&&&&&。
(5)为了获取重组质粒，将切割后的质粒与目的基因片段混合，并加入&&&&&&&&&&&&&&&
酶
(6)重组质粒中抗生素抗性基因的作用是为了&&&&&&&&&&&&&&&
。
(7)为了从cDNA文库中分离获取蔗糖转运蛋白基因，将重组质粒导入丧失吸收蔗糖能力的大肠杆菌突变体，然后在&&&&&&&&&
的培养基中培养，以完成目的基因表达的初步检测}