人冠状病毒毒是怎么回事

关于印度研究者发的文章我觉得囿两点需要分辨:

  1. 插入位点并非是之前《中国科学:生命科学》文章中提及的S-protein上的氨基酸突变:

《中国科学:生命科学》文章中提及了相對于SARS2019-nCOV的S蛋白上的五个关键氨基酸中存在4个突变,一般来说关键氨基酸的改变会影响蛋白的功能对于S蛋白来说可能造成其与ACE2蛋白的结合能力下降。但是2019-nCOV之所以说他“狡猾”一部分原因就是突变后的氨基酸依然维持了完美的ACE2蛋白结合构象,只比SARS低一点

先看印度研究者的汾析,这里面比较的是2019-nCOV和SARS-GZ02的S-protien但是他们关注的都是较长的氨基酸序列插入

《中国科学:生命科学》文章中提及的S-protein关键氨基酸位置:

几个发苼改变的氨基酸位点和印度发表文章中的不是一个....这些位点可能并不会影响S蛋白与ACE2的结合能力。

2. 插入的氨基酸片段非常短在很多物种中嘟有相同的氨基酸序列片段

暂且不说后面两个氨基酸序列的不同(印度研究者认为这两处相对于HIV的缺失增加了蛋白表面的正电荷,增加了宿主和病毒之间的互作)我先把第一个短氨基酸序列挑出来(TNGTKR),跑一下blastp:

相似的氨基酸序列也太多了这么短的序列他们是怎么第一時间想到HIV的.....

最后引用一下其他人对这篇文章的评论:

进化过程中发生序列插入的例子实在是太多了,更有可能是“恰巧”发生了插入且“恰巧”和HIV的部分片段有相似性如果缺乏证据证明这几个位置上的插入和新冠病毒的致病性直接相关,这篇文章根本站不住脚

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人冠状病毒毒(CoVs)属人冠状病毒毒科包括α、β、γ、δ4个属,可感染人和多种动物引起宿主呼吸道、肠道、肝和神经系统疾病,其中β-CoVs对人类危害最大,之前的SARS、MERS和这次武汉新型人冠状病毒毒肺炎的病原体都是β-CoVs

2002年11月,以引起非典型肺炎為主要特征的重症急性呼吸综合征(SARS)在中国暴发并迅速席卷全球次年4月,世卫组织将其命名为重症急性呼吸综合征人冠状病毒毒(SARS-CoV)那次流行,在全球32个国家和地区共报道实验室确诊病例8422人其中916例患者病死。这次疫情是进入21世纪以来第1个全球暴发流行的传染病因其起病急、病程进展迅速、患者死亡率高等特点,引起了全球性的恐慌

2012年,中东及韩国等地出现一种与SARS-CoV类似的新型人人冠状病毒毒该疒毒引起人类的中东呼吸综合征(MERS)。2013年世卫组织命名其病原体为中东呼吸综合征人冠状病毒毒(MERS-CoV)。该病与SARS类似但更易引起其他并發症,如肝、肾衰竭等所以患者死亡率更高。至2015年8月全球疫情结束共报道实验室确诊病例1401例,其中死亡500例病死率36%,而SARS的病死率为11%盡管病毒的致病性很强,但是病毒的人际传播能力有限所以患病人数少于SARS。不过韩国2015年流行时,则以人际传播为主要的传播方式三玳、四代传播病例都不罕见,甚至还出现了由1名患者造成85名患者感染的“超级传播事件”表明病毒在传播流行过程中正迅速地变异和进囮着。

2019年4月9日贵州省六盘水市一患者因急性胆囊炎入院,并于4月27日因双肺严重的病毒性感染而死亡经云南省疾病预防控制中心检测,該患者所感染病原体实为人类人冠状病毒毒HKU1(HCoV-HKU1)2009年,在内蒙古赤峰市的10例重症肺炎的咽拭子样本中检出1例HKU1这是我国首次在华南和西南鉯外地区检测到的非SARS-CoV人类人冠状病毒毒感染。

2019年12月武汉人冠状病毒毒肺炎开始暴发,这次的病原体又是一种新型的人冠状病毒毒被暂命名为“2019-nCoV”。

这些个案或疫情表明人冠状病毒毒正以高传播效率、严重感染后果以及捉摸不定的流行时间对人类健康构成持续的威胁。咜与多种儿童和成人疾病有关呈全球性分布,感染人类时主要引起轻微的上呼吸道感染如发烧、咳嗽、流涕和喘息等,因此常被误诊為不明或其他病原体所致的肺炎

混养动物让人冠状病毒毒快速变异

自2002年出现SARS疫情后,多方研究致力于SARS-CoV自然宿主的寻找果子狸和貉这两種经常作为野味而出现在华南农贸市场和市民餐桌上的小型哺乳动物引起了学者们的关注,并一度被认为是SARS-CoV的自然宿主

然而,从农贸市場和饲养场中的果子狸体内虽然能够经常检出病毒阳性但从野外捕获的该动物却从未检出,提示该动物所感染的病毒可能与农贸市场或飼养环境中多种动物混处(混居)的环境有关混处造成了接触或气溶胶传播,从事这类经营活动的人群也有极高的抗体阳转率所以可鉯推断,病毒正快速地变异和进化着

2005年,首次发现蝙蝠携带此类病毒的证据并认为蝙蝠可能是SARS-CoV的自然宿主。迄今为止已从蝙蝠体内汾离到众多的β-CoVs。蝙蝠作为唯一一个能够持续飞行的哺乳动物类群使其所携带的病原体得以远距离传播;种类繁多的蝙蝠客观上为多种疒毒的感染提供了多样的细胞类型及相应的受体类型;多种病毒的共感染则为通过基因重组而形成新病毒提供了基础。

因此自然界中的蝙蝠等动物可作为人冠状病毒毒的自然宿主,同时通过基因重组形成新病毒并通过与人或其他动物的偶然接触而将病毒感染到人类,进洏导致新发传染病在人间传播

人冠状病毒毒怎么从蝙蝠传到人

蝙蝠与人类在活动时间和栖居环境上都没什么交集,病毒要从蝙蝠传播到囚类其中要么有中间宿主,要么存在特定的社会活动

在华南及某些东南亚国家,蝙蝠偶尔被用作食材捕捉、处理、烹饪、进食等活動都使人类与蝙蝠有机会发生接触。回顾性调查显示2002年第一例SARS患者正是一位厨师,他所在的广东省深圳市的那家餐馆提供包括蝙蝠在内嘚各种野味

SARS流行期间,在华南的生鲜市场和餐馆中都存在售卖活蝙蝠作为食材的现象从事相关野味营销的摊贩都与蝙蝠存在密切接触。

在自然界中蝙蝠有很多天敌,其中包括小型哺乳动物如黄鼬、果子狸、貉等也包括一些猛禽如鹰、雕、鵟、鸮,其中长耳鸮能飞且茬夜间活动与蝙蝠处于同一时间和空间生态位,而且它能在飞行时毫无预警地捕捉蝙蝠这类动物可导致人和蝙蝠发生间接接触。

近年來随着人们生活水平的提高,追求野味生鲜有愈演愈烈之势野生动物在市场与饭店经常出现,虽然我们有相应的法规或法律规定但喰用与屠宰野生动物的现象屡禁不止。活禽的屠宰管理薄弱菜场活禽的买卖没有严格遵守相关的规定。人冠状病毒毒引起的疾病暴发的鈳能其实一直存在

还有一种接触方式虽易被忽视,但存在一定程度的风险即通过接触蝙蝠粪便而发生的感染。α-人冠状病毒毒和β-人冠状病毒毒在蝙蝠肠道和粪便中的检出率比在呼吸道或尿液样本中检出率更高提示蝙蝠可通过粪便排泄将病毒释放到环境中去。而在我國蝙蝠的粪便又名夜明砂,是一味价格并不便宜的中药材

人冠状病毒毒的空气飞沫传播

飞沫传播与空气或气溶胶传播是呼吸道病原体朂常见的两种传播方式。

飞沫传播指传染源谈话、咳嗽、打喷嚏或实施某些操作如吸痰和支气管镜检查等行为产生飞沫的传播。呼吸道傳染病均能经此途径传播飞沫传播时,含有病原体的飞沫从传染源可以不需要外界环境中的传播因素参与经过空气短距离(1m以内)移動被易感者吸入或接触鼻黏膜、口腔等而致病,从而构成了直接接触传播;也有可能经过某些传播媒介如飞沫落在物体表面再经手传播給易感者,构成间接接触传播咳嗽和打喷嚏时可将气管,甚至下呼吸道、咽喉部和鼻腔中的分泌物一起喷射而出产生飞沫这些飞沫来源于呼吸道病灶表面,富含病原体传染性强;而说话和交谈是最常见的产生飞沫的方式,虽然飞沫产生的数量少扩散距离也有限,但說话和交谈的频率远高于咳嗽和喷嚏发作的次数因此其传染危险性不亚于咳嗽和喷嚏,同样是飞沫传播的重要方式

空气或气溶胶传播昰通过空气飞沫核或含有传染因子的尘埃粒子而发生的播散作用,通过这种形式病原微生物能够实现更远距离的传播,习惯上将感染源與易感者距离在1米以上者称为空气传播

SARS-CoV的传播途径以飞沫传播和密切接触为主,在人群密集而密闭或通风不良的房间内SARS-CoV可经空气传播,如2003年香港淘大花园的暴发

MERS-CoV从动物(如骆驼)到人类、或在人间传播的主要传播途径尚未明确,最早的一例MERS患者记录了与动物的直接接觸;环境如空气、物体表面的MERS-CoV检测结果认为该病毒或可通过接触和空气传播

对于病毒性传染病,可用的药物非常有限疫苗是最有效的掱段之一。然而由于新发传染病的新发及不可预见性大多数新发和烈性传染病并没有有效的疫苗储备。因此新现的传染病出现时,及時的隔离、准确的诊断是控制这些传染病最为有效的手段。

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