1 账套管理： 金蝶标准版一年度一個账套年结后需转换新账套，且不支持跨年度查询；而金蝶kis专业版则无需转换新账套多年度一个套账，及跨年度查询数据

2 会计科目： 金蝶标准版的科目设置要按照先定义好的级次进行设置，设置完成不得更改；而金蝶kis专业版则可以灵活修改科目级次不受限制；对于核算项目，金蝶标准版只能设置3个而专业版则可以设置达9999个。

3 业务系统： 标准版的没有业务模块只有总账、报表、固定资产、出纳管悝及往来工资等；专业版除了具备标准版已有基础模块，基础模块更为深入还包含多项业务模块，如：供应链管理（采购、销售、仓存等）、应收应付管理、生产管理等

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