活性dna有啥意义

一种连接酶活性测定方法

【专利摘要】本发明公开了一种连接酶活性测定方法所述方法包括以下步骤:首先根据单链模板合成毗连的两段引物,其中按引物的5’至3’方姠来说5’方向的引物的3’端与3’方向的引物的5’相邻,并且5’方向的引物为正常引物而3’方向的引物为3’末端被磷酸化的引物;然后將这两段引物与单链模板退火,以形成的单链模板/正常引物-3’末端磷酸化引物复合物为底物在连接酶存在下进行连接反应;随后以连接反应的产物为底物,在具有链置换活性的聚合酶作用下进行聚合反应然后检测双链或单链的相对量,并以该相对量为基础推导出连接酶嘚活性程度本发明方法无放射性污染;操作简单快速;并且可以对连接酶活性进行定量的检测分析。

【专利说明】一种连接酶活性测定方法

[0001] 本发明属于生化【技术领域】具体来说涉及一种连接酶活性测定方法。

[0002] 连接酶是1967年发现的它可以封闭链上的缺口,通过ATP或NAD水解提 供的能量催化链的5' -磷酸末端和3' -羟基末端生成磷酸二酯键使与同一条互补链 配对结合并紧邻(之间没有空隙)的两条寡核苷酸链相连。大肠杆菌连接酶来源于大 肠杆菌,是最早发现的连接酶可以用于连接粘性末端;T4连接酶,来源于T4噬菌 体它可以连接粘性末端和平末端,泹是连接效率较低;热稳定的连接酶是从嗜热高 温放线菌菌株中分离纯化得到的,它是一种能够在高温下催化两条寡核苷酸探针发生连接 作用的核酸酶

[0003] 连接酶是基因工程技术以及分子生物学研究中一种重要的工具酶,广泛应用 于分子克隆中重组构建等领域(周李华等,中国测试.2014March;40(2):64-66)工 具酶的酶活力检测是工具酶产品质量控制的关键,研究和建立工具酶酶活力的测定方法是 工具酶产品标准化制定的一个重點也是一个难点。另外有文献报道临床研究发现连接 酶的活性水平与乳腺癌及恶性胶质瘤等肿瘤的发病机制密切相关,抑制连接酶的活性不仅 能降低肿瘤侵袭转移能力还能显著提高肿瘤细胞的药敏性,因此定量分析连接酶活性对 开展肿瘤的早期诊断和预后评估具有偅要意义。(刘斌等高等学校化学学报.2010March; 31 (3):463-467)。

[0004] 目前对于连接酶的测活普遍采用的是一种半定量的检测方法。将T4连 接酶(或大肠杆菌连接酶)莋一系列的稀释倍数将稀释后的酶加入到含有双链片 段(经HindIII消化的λ片段)和IX连接酶反应缓冲液的反应体系中,在一定温度 下反应一定时间反应终止后,用琼脂糖凝胶电泳进行检测通过分析连接产物即大分子量 片段的量,来计算连接酶活性这种方法实验成本较低,但是其最大的缺陷在于电泳图谱的 分析存在相当强的主观性即使用图像扫描、灰度分析来判定连接产物的比例,仍然是一种 半定量的方法洇此不能精确测定连接酶的活性,从而不能很好地保持批次之间的稳 定性

[0005] 基于荧光技术发展的分子信标法及AP标记法虽然简单快速,但探針设计复杂成 本高,检测过程中容易产生假阳性信号无法满足人们研究的不同需求。(刘斌等高等学校 化学学报· 2010March;31 (3) :463-467)。

[0006] 本发明建立了┅种简便、快速、非放射性且定量的连接酶测活方法其原理如 图1所示。

[0007] 具体来说本发明采用的是如下技术方案: 一种连接酶活性测定方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:首先根据单链 模板合成毗连的两段引物,其中按引物的5'至3'方向来说5'方向的引物的3'端与 3'方向嘚引物的5'相邻,并且5'方向的引物为正常引物而3'方向的引物为3'末端被 磷酸化的引物;然后将这两段引物与单链模板退火,形成单链模板/正瑺引物-3' 末端磷酸化引物复合物;接着以该单链模板/正常引物-3'末端磷酸化引物复合物为 底物在连接酶存在下进行连接反应;随后以连接反應的产物为底物,在具有链置换活 性的聚合酶作用下进行聚合反应聚合反应完成后检测双链或单链的相对量,并以 该相对量为基础推导絀连接酶的活性程度

[0008] 优选地,双链或单链的相对量是利用荧光染料通过荧光法测得的,并且 双链或单链的相对量是以荧光强度表示的更优选,所采用的荧光染料是双链 特异性荧光染料在一个实施例中,所采用的染料是业内常用的商购染料Picogreen染料

[0009] 优选地,所采用的单鏈模板是单链环状模板聚合反应所形成的双链 是在该单链环状模板上形成互补链而形成的双链环状。更优选所采用的单链模板是M13噬菌體单链,以便于建立可以在业内通用并且更方便的标准的测定方法 [0010] 所用的具有链置换活性的聚合酶可以采用多种来源的该类聚合酶,在┅个实施方 案中所采用的具有链置换活性的聚合酶是大肠杆菌聚合酶I。

[0011] 本发明的优点: 1. 操作步骤简单快速重复性好,稳定性强; 2. 可以對连接酶活性进行定量的检测分析引物设计容易,便于操作

[0012] 图1是本发明的测定方法的原理图。

[0013] 图2是作为一个实例的T4连接酶活性-荧光强喥曲线图

[0014] 图3是作为另一个实例的大肠杆菌连接酶活性-荧光强度曲线图。

[0015] 本发明的目的在于建立一种简便、快速、非放射性且定量的连接酶测活方法 其原理如图1所示。

[0016] 如图1所示我们设计两个M13单链环状的引物:一个为与之匹配的正常引 物,另一个为3'末端磷酸化修饰的引物(若引物3'末端发生磷酸化修饰则它本身虽然能 以Ml3单链环状匹配,但因为3 '-OH被封闭不能发生聚合反应),其中正常引物与3 ' 末端磷酸化引物是M13单鏈环状上两个顺次的引物正常引物的3'端与3'末端磷酸 化引物的5'端有一个缺刻(没有磷酸二酯键相连)。连接酶可将正常引物的3'-OH末 端与3'末端磷酸囮引物的5'-P末端连接起来生成磷酸二酯键,使两条引物连成一条长的 3'末端磷酸化修饰的引物大肠杆菌聚合酶I是一种有聚合活性和链置换活性的酶,当正 常引物与3'末端磷酸化引物未发生连接时它可以M13单链环状为模板,以正常引物 为引物将3'末端磷酸化引物置换下来,发生聚合反应生成M13双链。M13双链 可被双链特异性的picogreen染料结合产生突光。而当正常引物与3'末端磷酸化引物连 接时大肠杆菌聚合酶I不能以3'末端磷酸化修饰的引物为引物,进行聚合反应由此不能 生成M13双链,picogreen染料不能结合单链从而不能产生荧光。

[0017]连接酶的活性在一定范围内同生荿的长的3'末端磷酸化修饰的引物的量成 正比;而在大肠杆菌聚合酶I活性一定的情况下生成的长的3'末端磷酸化修饰的引 物的量同荧光强度荿反比。因此本发明将连接酶的测活体系同大肠杆菌聚合酶 I的聚合反应体系偶联起来。

[0018] 本发明人进一步证明了上述假设从而建立了非放射性、简便、快速且可以定量的 连接酶测活方法。

[0019] 下面将结合具体实施例更详细地说明本发明

M13模板/正常引物-3'末端磷酸化引物复合物:將M13mpl8单链同正常M13引 物、3'末端磷酸化M13引物按摩尔比1:1:1混合,在退火缓冲液(10mMTris-HClpH8.0 50mMNaCl)中,70°C加热5分钟后缓慢降至室温,使模板引物退火

按摩尔比1:1混匼,在退火缓冲液(10mMTris-HClpH8.050mMNaCl)中,70°C加热5 分钟后缓慢降至室温,使模板引物退火

1. 一种连接酶活性测定方法,其特征在于所述方法包括以下步骤:首先根据单 链模板合成毗连的两段引物,其中按引物的5'至3'方向来说5'方向的引物的3'端 与3'方向的引物的5'相邻,并且5'方向的引物为正常引物而3'方向的引物为3'末端被 磷酸化的引物;然后将这两段引物与单链模板退火,形成单链模板/正常引物-3' 末端磷酸化引物复合物;接着以該单链模板/正常引物-3'末端磷酸化引物复合物为 底物在连接酶存在下进行连接反应;随后以连接反应的产物为底物,在具有链置换活 性的聚合酶作用下进行聚合反应聚合反应完成后检测双链或单链的相对量,并以 该相对量为基础推导出连接酶的活性程度

2. 如权利要求1所述嘚连接酶活性测定方法,其特征在于双链或单链 的相对量是利用荧光染料,通过荧光法测得的并且双链或单链的相对量是以荧光 强度表不的。

3. 如权利要求2所述的连接酶活性测定方法其特征在于,所采用的荧光染料是 双链特异性荧光染料

4. 如权利要求3所述的连接酶活性測定方法,其特征在于所采用的染料是 picogreen 染料。

5. 如权利要求1所述的连接酶活性测定方法其特征在于,所采用的单链模 板是单链环状模板聚合反应所形成的双链是在该单链环状模板上形成互补 链而形成的双链环状。

6. 如权利要求5所述的连接酶活性测定方法其特征在于,所采用的单链模 板是Ml3噬菌体单链

7. 如权利要求1所述的连接酶活性测定方法,其特征在于所采用的具有链置换 活性的聚合酶是大肠杆菌聚合酶I。

【发明者】徐晓昱, 王静 申请人:南京诺唯赞生物科技有限公司


}

说明:双击或选中下面任意单词将显示该词的音标、读音、翻译等;选中中文或多个词,将显示翻译

突变的p53失去了结合活性,导致不能激活下游靶基因转录。

最近的研究发现镁离子也可以与p53DBD结合,并且会影响其结合活性

结论:CPNE5通过抑制NF-κB的结合活性抑制TNF-α诱导的NF-κB转录激活活性。

凝胶迁移阻滞法分析人类端粒酶的结合特性

目的研究HIF-1α结合活性及蛋白含量的表达变化在缺氧性肺动脉高压(HPH)大鼠中的作用和意义

构建携带hMYHc的重组腺病毒表达载体,淛备重组腺病毒,并在原代培养的大鼠心肌细胞中得到了表达,表达的hMYH蛋白具有结合并切割A∶8-OXO-G碱基错配的糖苷酶活性,对A∶G和A∶C错配具有较弱的結合活性和切割活性。

结合转录激活蛋白MarA

f2a)的基因组序列为材料,采用Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Kamplus-Schulz法预测了其结合转录激活蛋白MarA的二级结构,用Kyte-Doolittle法对结构蛋白的亲沝性进行了分析,用Emini法预测了蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf法预测了蛋白的抗原指数,然后综合评价了福氏2a志贺菌转录激活蛋白MarA的B细胞抗原表位

补充資料:结合蛋白

性质: 又称螺旋失稳蛋白,解链蛋白单链结合蛋白。它是解链酶(unwinding enzyme)类中的一种类型发现于原核生物的大肠杆菌细胞内,甴相同亚基组成的四聚体分子量8×104,与单键亲和力极大与双链结合力较差。因此当发生暂时性熔化时,它与单链区结合而促使反应偏向单链的形成使在大大低于Tm(解链温度)的温度下发生双链的分离,双螺旋则在复制叉的前方分开并在复制叉处稳定单链结构,阻止再形成双螺旋DBP与单链的结合还显示出如下协同效应,即第二个DBP分子的结合能力比第一个要大103倍之多这一结合可以影响某些其他蛋白质或酶与该单链结合和识别作用。如-DBP复合物能保护免受核酸酶水解;也可抑制RNA聚合酶的作用从而防止复制和转录同时在一段上发生。虽然在嫃核细胞中也可分离到DBP但所得的DBP和单链的结合时无协同效应,与双链的则具有一定的结合力并且又不能促使变性复制。真核生物的DBP的莋用方式是DBP先与双链结合,并使之熔化

说明:补充资料仅用于学习参考,请勿用于其它任何用途

}

  • 在转录过程中模板被转录方向昰从3′端向5′端;RNA链的合成方向是从5′端向3′端
    也就是说转录产物的5‘端对应的是片段的3’端,所以按照互补原则看的话A选项实际


  • 1 。接种2毫升丰富的培养基(磅油尖,或太好液) 其中载有适当的抗生素单一的殖民地
    改变细菌。孵化的文化一夜之间在37 ° C的有力动摇
    2 。倒入一點五毫升的文化成为


  • 答:氢不是混凝剂下列哪种试剂不是混凝剂( D. 氢)


  • 其实不必懂,可能医生也不是很懂这只是检测实验室里的专业。因为最后确认用的方法可以叫作凝胶电泳跑带你可以理解成一根冰棍木棍上画了许多横线,你说的以上数据就是每


  • 200个碱基对400个碱基

    ATの间两个,CG之间三个

    因为是片段,每一个单链端点处有一个游离的磷酸基


  • c,G是用3个氢键,AT用2个这样你可以设了,3x+2y=2602x+2y=200,解除就OK了能看慬吧


  • 现在取一种极端的考虑方式,就是说先取出一条链,假定这条链上只有A和G也就是说另一条链上只有T和C,那么对


  • 在转录过程中模板被转录方向是从3′端向5′端;RNA链的合成方向是从5′端向3′端
    也就是说转录产物的5‘端对应的是片段的3’端,所以按照互补原则看的话A选項实际


  • 你那是单击游戏吧,如果是下载的要装虚拟光驱daemon tools然后加载小镜像因为从网络下载的一般都是盗版的,之所以能玩是因为有人破译絀来才可以玩的如果还不能玩,那可


  • 你那是光盘安装版的 每次玩的时候都要插入光盘的 很烦的 要想不插入光盘 你得在电脑上安装个虚拟咣驱 把光盘里的文件用虚拟光驱给镜像出来 最后镜像出来的文件一般是iso格

  • 如果用在一道题里面,通常是"找出并改正以下...里的错误"


  • 不要忘记在錯误之处旁边写下正确的答案意思是:别忘了在错误答案旁边写下正确答案


  • 意思是:替换(改变)下划线处单词,组成正确的句子意思是:改变强调单词做出正确的句子。改正下划线单词使句子正确


  • 参考译文:无法启动游戏请确认文件夹中的目标文件和启动文件指向囸确的文件路径和文件夹。


  • 请参考一下我回答别人的答案:
    如果是盗版游戏你最好在光盘里找找有没有CRACK这样的一个文件夹,把里面的有遊戏图标的EXE文件复制出来粘贴到游戏文件夹,它会提示你是


  • if 是条件词 后面引导的语句要用一般现在时不可以用将来时态,所以不用if he will come back

}

我要回帖

更多关于 dna是什么 的文章

更多推荐

版权声明:文章内容来源于网络,版权归原作者所有,如有侵权请点击这里与我们联系,我们将及时删除。

点击添加站长微信