通过肿瘤质子治疗能量的捆绑直接作用于肿瘤部位并减少健康组织部位的整体放射剂量在各个肿瘤几何体积相同肿瘤照射剂量的比较下，肿瘤质子治疗照射只是普通X射線照射的三分之一或者更少这使得治疗有效剂量增加，从而使得肿瘤细胞可以得到有效破坏理论上来说可以使还未转移的肿瘤治疗机會提高，文献中显示例如颅底脊索瘤利用X射线放疗的“局部控制率”为20%至50%，而肿瘤质子治疗照射的“局部控制率”为70%-80%通过对超过2000例肿瘤质子治疗治疗患者的分析肿瘤治愈率达到了98%（眼部黑色素瘤，文献同上）

频繁的放射治疗对机体的负荷非常严重，以致于必须要住院進行治疗然而肿瘤质子治疗治疗的使用与破坏辐射的有效比例允许在治疗肿瘤剂量增加的同时并限制副作用，对于健康组织的损坏剂量吔会同时降低因此肿瘤质子治疗放射治疗有相对良好的耐受性，可以在大多数情况下进行门诊治疗此外放射后效的继发性肿瘤产生风險也大大降低。这种辐射诱发的肿瘤概率是每10年1%因此对于儿童肿瘤患者，长远来看肿瘤质子治疗治疗是必要的。

通过肿瘤质子治疗能量的捆绑直接作用于肿瘤部位并减少健康组织部位的整体放射剂量在各个肿瘤几何体积相同肿瘤照射剂量的比较下，肿瘤质子治疗照射呮是普通X射线照射的三分之一或者更少这使得治疗有效剂量增加，从而使得肿瘤细胞可以得到有效破坏理论上来说可以使还未转移的腫瘤治疗机会提高，文献中显示例如颅底脊索瘤利用X射线放疗的“局部控制率”为20%至50%，而肿瘤质子治疗照射的“局部控制率”为70%-80%通过對超过2000例肿瘤质子治疗治疗患者的分析肿瘤治愈率达到了98%（眼部黑色素瘤，文献同上）

肿瘤质子治疗照射单次剂量的提高，可以使得相對于普通X射线照射通常所需要的照射次数显著减少这也就意味着使参与者更为轻松并且患者的治疗时间更短。