【病原菌】菌核病是真菌病害，病原菌有核盘菌和小核盘菌，都属于子囊菌门，盘菌亚门，锤舌菌纲，柔膜菌目，核盘菌科，核盘菌属。
【发生规律】 病原菌主要以菌核在土壤内，病残体中或夹杂在种子间越冬。菌核经3-4个月的休眠期，就可以萌发。菌核有两种萌发方式，分别产生侵染菌丝或子囊盘。春季温度适宜，土壤较干燥时，土壤内的菌核萌发，产生侵染菌丝，侵入根部，造成根腐，继而病原菌上行进入茎部，导致茎基部腐烂和病株萎蔫死亡。病原菌还借助植株间根系的接触而侵染邻近植株，使病株不断增多，发病区段迅速扩大。
春季气温回升至5℃以上，土壤潮湿时，土壤中的菌核萌发，产生子囊盘而突出地面。以这种方式萌发的菌核大多分布于土壤表层1-3厘米内，埋深7厘米以上的的菌核就很难以这种方式萌发。子囊盘内产生子囊和子囊孢子。子囊孢子成熟后被弹射释放到空中，随气流传播，着落在向日葵植株上。有人测得子囊孢子随着气流传播距离，至少可达1600米。植物体表有水膜存在时，子囊孢子萌发，产生芽管，由伤口侵入，引起茎腐、叶腐或盘腐。核盘菌也能侵入种子，造成种子内部带菌。播种带菌种子，可发生芽死、苗腐或幼苗立枯。
核盘菌可在死亡或衰老的植物组织上存活繁衍。在病株枯死的根上、茎杆表面、茎杆内部以及腐烂的花盘中，都能产生许多菌核。一个病株大约可产生25-100个菌核。菌核着落于土壤，或随病残体进入土壤，就能成为下一季作物发病的菌源。菌核可随风雨、灌溉水、土壤、农机具在田块间传播，可可夹杂在种子间远程传播。
菌核在土壤中可存活多年，土壤中菌核数量越多，发病就越重，该田块保持致病能力的年限也越长。连作田土壤中菌核量大，发病重，换种核盘菌的非寄主作物后，土壤中菌核数量逐年下降，发病率也随之降低。
土壤温度和湿度也是影响发病的重要因子。核盘菌生长的温度范围为0℃-37℃，最适温度为25℃。菌核形成的温度范围5℃-30℃，最适温度15℃。形成子囊盘的温度范围0℃-35℃，在5℃-10℃时萌发最快。病原菌侵入适温为15℃-18℃，春季低温多雨，土壤湿度高，根腐、茎基腐发生重，花期7-8月份多雨高湿，适于子囊孢子侵染，盘腐严重。若适期晚播，错开雨季，就能减轻发病。
播量过大，植株密度高，有利于病原菌传播致病，发病较重。在高密度时，病株倒伏也增多。
【防治方法】
避免向日葵重茬和迎茬，与麦类、玉米、高粱等禾本科非寄主作物实行3年以上轮作。发病率高，土壤中菌核数量较多的田块，应行长期轮作。有人提出枯萎株率低于10%，应行3-5年轮作，高于10%的，应行6-8年以上的轮作。
2、田间卫生
收获后清除田间病残体，刨出根茬，集中烧毁，深翻土地，将地面上菌核翻入深土中（10-15厘米以下）使其不能萌发。防除田间阔叶杂草，铲除向日葵自生苗，发病田早期拔除病株。
3、种子处理
机械汰除种子间夹杂的菌核，或用35℃-37℃温水浸种7-8分钟，不断搅拌，菌核吸水下沉，捞出上层种子晾干。另外，用58℃-60℃温汤浸种10-20分钟，可杀死种子内部带菌。药剂拌种用种子量0.3%的50%腐霉利（速克灵）可湿性粉剂或40%菌核净（纹枯利）可湿性粉剂。药液浸种可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，浸种4小时。种子还可用2.5%咯菌腈悬浮种衣剂包衣，100千克种子用药600-800毫升。
4、加强田间管理
与矮杆作物（菜豆、大豆等）间作；适期晚播，例如内蒙巴盟推迟播种到6月1日前后；合理密植，实行地膜覆盖，大小行种植，食葵密度每亩2500株左右，叶片茂盛的品种酌情减少；配方施肥，控制氮肥，配合磷、钾肥或施用向日葵专用肥，培育壮苗；平整土地，合理灌溉，防止大水漫灌和田间积水；生育后期盘腐扩展快，应及时收获或适时早收，以减少损失。
5、种植抗病、耐病品种
加强抗病品种的鉴选，推广种植抗病、耐病品种。
6、药剂防治
土壤处理用50%腐霉利可湿性粉剂每亩1千克混拌适量沙土，在播种进均匀随种子施入播种沟内。
在盛花期至成熟期喷药2-3次，可选用40%菌核净（纹枯利）可湿性粉剂500-1000倍液，50%乙烯菌核利（农利灵）水分散性粒剂1000倍液，50%腐霉利（速克灵）可湿性粉剂倍液，70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1000倍液，60%多菌灵盐酸盐（防霉宝）超微可湿性粉剂1000倍液，50%多菌灵可湿性粉剂500倍液等，重点喷布茎基部、花盘背面。
另外，还可在发病初期，用腐霉利药液或菌核净药液灌根，间隔7-10天后再灌一次。　
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